Protein–RNA interactions for Protein: O15049

N4BP3, NEDD4-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP3O15049 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
N4BP3O15049 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
N4BP3O15049 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
N4BP3O15049 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
N4BP3O15049 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
N4BP3O15049 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
N4BP3O15049 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
N4BP3O15049 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
N4BP3O15049 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
N4BP3O15049 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
N4BP3O15049 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
N4BP3O15049 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
N4BP3O15049 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
N4BP3O15049 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
N4BP3O15049 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
N4BP3O15049 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
N4BP3O15049 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
N4BP3O15049 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
N4BP3O15049 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
N4BP3O15049 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
N4BP3O15049 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
N4BP3O15049 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
N4BP3O15049 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
N4BP3O15049 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
N4BP3O15049 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
N4BP3O15049 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
N4BP3O15049 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
N4BP3O15049 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
N4BP3O15049 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
N4BP3O15049 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
N4BP3O15049 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
N4BP3O15049 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
N4BP3O15049 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
N4BP3O15049 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
N4BP3O15049 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
N4BP3O15049 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
N4BP3O15049 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
N4BP3O15049 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
N4BP3O15049 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
N4BP3O15049 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
N4BP3O15049 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
N4BP3O15049 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
N4BP3O15049 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
N4BP3O15049 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
N4BP3O15049 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
N4BP3O15049 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
N4BP3O15049 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
N4BP3O15049 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
N4BP3O15049 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
N4BP3O15049 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
N4BP3O15049 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
N4BP3O15049 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
N4BP3O15049 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
N4BP3O15049 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
N4BP3O15049 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
N4BP3O15049 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
N4BP3O15049 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
N4BP3O15049 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
N4BP3O15049 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
N4BP3O15049 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
N4BP3O15049 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
N4BP3O15049 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
N4BP3O15049 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
N4BP3O15049 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
N4BP3O15049 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
N4BP3O15049 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
N4BP3O15049 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
N4BP3O15049 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
N4BP3O15049 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
N4BP3O15049 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
N4BP3O15049 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
N4BP3O15049 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
N4BP3O15049 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
N4BP3O15049 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
N4BP3O15049 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
N4BP3O15049 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
N4BP3O15049 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
N4BP3O15049 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
N4BP3O15049 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
N4BP3O15049 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
N4BP3O15049 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
N4BP3O15049 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
N4BP3O15049 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
N4BP3O15049 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
N4BP3O15049 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
N4BP3O15049 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
N4BP3O15049 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
N4BP3O15049 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
N4BP3O15049 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
N4BP3O15049 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
N4BP3O15049 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
N4BP3O15049 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
N4BP3O15049 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
N4BP3O15049 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
N4BP3O15049 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
N4BP3O15049 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
N4BP3O15049 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
N4BP3O15049 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
N4BP3O15049 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
N4BP3O15049 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms