Protein–RNA interactions for Protein: A6NED2

RCCD1, RCC1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCCD1A6NED2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RCCD1A6NED2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RCCD1A6NED2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RCCD1A6NED2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RCCD1A6NED2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RCCD1A6NED2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RCCD1A6NED2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RCCD1A6NED2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RCCD1A6NED2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RCCD1A6NED2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RCCD1A6NED2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RCCD1A6NED2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RCCD1A6NED2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RCCD1A6NED2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RCCD1A6NED2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RCCD1A6NED2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RCCD1A6NED2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RCCD1A6NED2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RCCD1A6NED2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RCCD1A6NED2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RCCD1A6NED2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RCCD1A6NED2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RCCD1A6NED2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RCCD1A6NED2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RCCD1A6NED2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RCCD1A6NED2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RCCD1A6NED2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RCCD1A6NED2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RCCD1A6NED2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RCCD1A6NED2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RCCD1A6NED2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RCCD1A6NED2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RCCD1A6NED2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RCCD1A6NED2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RCCD1A6NED2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RCCD1A6NED2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RCCD1A6NED2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RCCD1A6NED2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RCCD1A6NED2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RCCD1A6NED2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RCCD1A6NED2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RCCD1A6NED2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RCCD1A6NED2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RCCD1A6NED2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RCCD1A6NED2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RCCD1A6NED2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RCCD1A6NED2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RCCD1A6NED2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RCCD1A6NED2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RCCD1A6NED2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RCCD1A6NED2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RCCD1A6NED2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RCCD1A6NED2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RCCD1A6NED2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RCCD1A6NED2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RCCD1A6NED2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RCCD1A6NED2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RCCD1A6NED2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RCCD1A6NED2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RCCD1A6NED2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RCCD1A6NED2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RCCD1A6NED2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RCCD1A6NED2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RCCD1A6NED2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RCCD1A6NED2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RCCD1A6NED2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RCCD1A6NED2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RCCD1A6NED2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RCCD1A6NED2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RCCD1A6NED2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RCCD1A6NED2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RCCD1A6NED2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RCCD1A6NED2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RCCD1A6NED2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RCCD1A6NED2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RCCD1A6NED2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RCCD1A6NED2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RCCD1A6NED2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RCCD1A6NED2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RCCD1A6NED2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RCCD1A6NED2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RCCD1A6NED2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RCCD1A6NED2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RCCD1A6NED2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RCCD1A6NED2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RCCD1A6NED2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RCCD1A6NED2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RCCD1A6NED2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RCCD1A6NED2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RCCD1A6NED2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RCCD1A6NED2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RCCD1A6NED2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RCCD1A6NED2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RCCD1A6NED2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RCCD1A6NED2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RCCD1A6NED2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RCCD1A6NED2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RCCD1A6NED2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RCCD1A6NED2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RCCD1A6NED2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms