Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PALM3A6NDB9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PALM3A6NDB9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PALM3A6NDB9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PALM3A6NDB9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PALM3A6NDB9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PALM3A6NDB9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PALM3A6NDB9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PALM3A6NDB9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PALM3A6NDB9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PALM3A6NDB9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PALM3A6NDB9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PALM3A6NDB9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PALM3A6NDB9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PALM3A6NDB9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PALM3A6NDB9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PALM3A6NDB9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PALM3A6NDB9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PALM3A6NDB9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PALM3A6NDB9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PALM3A6NDB9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PALM3A6NDB9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PALM3A6NDB9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PALM3A6NDB9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PALM3A6NDB9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PALM3A6NDB9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PALM3A6NDB9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PALM3A6NDB9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PALM3A6NDB9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PALM3A6NDB9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PALM3A6NDB9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PALM3A6NDB9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PALM3A6NDB9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PALM3A6NDB9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PALM3A6NDB9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PALM3A6NDB9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PALM3A6NDB9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PALM3A6NDB9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PALM3A6NDB9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PALM3A6NDB9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PALM3A6NDB9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PALM3A6NDB9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PALM3A6NDB9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PALM3A6NDB9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PALM3A6NDB9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PALM3A6NDB9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PALM3A6NDB9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PALM3A6NDB9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PALM3A6NDB9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PALM3A6NDB9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PALM3A6NDB9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PALM3A6NDB9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PALM3A6NDB9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PALM3A6NDB9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PALM3A6NDB9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PALM3A6NDB9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PALM3A6NDB9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PALM3A6NDB9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PALM3A6NDB9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PALM3A6NDB9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PALM3A6NDB9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PALM3A6NDB9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PALM3A6NDB9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PALM3A6NDB9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PALM3A6NDB9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PALM3A6NDB9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PALM3A6NDB9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PALM3A6NDB9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PALM3A6NDB9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PALM3A6NDB9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PALM3A6NDB9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PALM3A6NDB9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PALM3A6NDB9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PALM3A6NDB9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PALM3A6NDB9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PALM3A6NDB9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PALM3A6NDB9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PALM3A6NDB9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PALM3A6NDB9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PALM3A6NDB9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PALM3A6NDB9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PALM3A6NDB9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PALM3A6NDB9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PALM3A6NDB9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PALM3A6NDB9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PALM3A6NDB9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PALM3A6NDB9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PALM3A6NDB9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PALM3A6NDB9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PALM3A6NDB9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PALM3A6NDB9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PALM3A6NDB9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PALM3A6NDB9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PALM3A6NDB9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PALM3A6NDB9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PALM3A6NDB9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PALM3A6NDB9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PALM3A6NDB9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PALM3A6NDB9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PALM3A6NDB9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms