Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARFGEF2Q9Y6D5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARFGEF2Q9Y6D5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARFGEF2Q9Y6D5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARFGEF2Q9Y6D5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ARFGEF2Q9Y6D5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
ARFGEF2Q9Y6D5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ARFGEF2Q9Y6D5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ARFGEF2Q9Y6D5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ARFGEF2Q9Y6D5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ARFGEF2Q9Y6D5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
ARFGEF2Q9Y6D5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ARFGEF2Q9Y6D5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ARFGEF2Q9Y6D5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ARFGEF2Q9Y6D5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ARFGEF2Q9Y6D5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARFGEF2Q9Y6D5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARFGEF2Q9Y6D5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARFGEF2Q9Y6D5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARFGEF2Q9Y6D5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARFGEF2Q9Y6D5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARFGEF2Q9Y6D5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARFGEF2Q9Y6D5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARFGEF2Q9Y6D5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARFGEF2Q9Y6D5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARFGEF2Q9Y6D5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARFGEF2Q9Y6D5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARFGEF2Q9Y6D5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
ARFGEF2Q9Y6D5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARFGEF2Q9Y6D5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARFGEF2Q9Y6D5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARFGEF2Q9Y6D5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARFGEF2Q9Y6D5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
ARFGEF2Q9Y6D5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARFGEF2Q9Y6D5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARFGEF2Q9Y6D5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARFGEF2Q9Y6D5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARFGEF2Q9Y6D5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARFGEF2Q9Y6D5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARFGEF2Q9Y6D5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
ARFGEF2Q9Y6D5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARFGEF2Q9Y6D5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARFGEF2Q9Y6D5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARFGEF2Q9Y6D5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARFGEF2Q9Y6D5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARFGEF2Q9Y6D5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARFGEF2Q9Y6D5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARFGEF2Q9Y6D5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARFGEF2Q9Y6D5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARFGEF2Q9Y6D5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARFGEF2Q9Y6D5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARFGEF2Q9Y6D5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARFGEF2Q9Y6D5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ARFGEF2Q9Y6D5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARFGEF2Q9Y6D5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARFGEF2Q9Y6D5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARFGEF2Q9Y6D5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARFGEF2Q9Y6D5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARFGEF2Q9Y6D5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARFGEF2Q9Y6D5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARFGEF2Q9Y6D5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARFGEF2Q9Y6D5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
ARFGEF2Q9Y6D5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARFGEF2Q9Y6D5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
ARFGEF2Q9Y6D5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARFGEF2Q9Y6D5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARFGEF2Q9Y6D5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARFGEF2Q9Y6D5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARFGEF2Q9Y6D5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARFGEF2Q9Y6D5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARFGEF2Q9Y6D5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ARFGEF2Q9Y6D5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARFGEF2Q9Y6D5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARFGEF2Q9Y6D5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARFGEF2Q9Y6D5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARFGEF2Q9Y6D5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ARFGEF2Q9Y6D5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARFGEF2Q9Y6D5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARFGEF2Q9Y6D5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARFGEF2Q9Y6D5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ARFGEF2Q9Y6D5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ARFGEF2Q9Y6D5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ARFGEF2Q9Y6D5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ARFGEF2Q9Y6D5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARFGEF2Q9Y6D5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARFGEF2Q9Y6D5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
ARFGEF2Q9Y6D5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARFGEF2Q9Y6D5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARFGEF2Q9Y6D5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ARFGEF2Q9Y6D5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
ARFGEF2Q9Y6D5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ARFGEF2Q9Y6D5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ARFGEF2Q9Y6D5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms