Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLF12Q9Y4X4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLF12Q9Y4X4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms