Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DTX4Q9Y2E6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DTX4Q9Y2E6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DTX4Q9Y2E6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DTX4Q9Y2E6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DTX4Q9Y2E6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DTX4Q9Y2E6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
DTX4Q9Y2E6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
DTX4Q9Y2E6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DTX4Q9Y2E6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DTX4Q9Y2E6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DTX4Q9Y2E6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DTX4Q9Y2E6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DTX4Q9Y2E6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DTX4Q9Y2E6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DTX4Q9Y2E6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DTX4Q9Y2E6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DTX4Q9Y2E6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DTX4Q9Y2E6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DTX4Q9Y2E6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DTX4Q9Y2E6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DTX4Q9Y2E6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DTX4Q9Y2E6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DTX4Q9Y2E6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DTX4Q9Y2E6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DTX4Q9Y2E6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DTX4Q9Y2E6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DTX4Q9Y2E6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DTX4Q9Y2E6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DTX4Q9Y2E6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DTX4Q9Y2E6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DTX4Q9Y2E6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DTX4Q9Y2E6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DTX4Q9Y2E6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DTX4Q9Y2E6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DTX4Q9Y2E6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DTX4Q9Y2E6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DTX4Q9Y2E6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DTX4Q9Y2E6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DTX4Q9Y2E6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DTX4Q9Y2E6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DTX4Q9Y2E6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DTX4Q9Y2E6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DTX4Q9Y2E6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DTX4Q9Y2E6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DTX4Q9Y2E6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DTX4Q9Y2E6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
DTX4Q9Y2E6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DTX4Q9Y2E6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DTX4Q9Y2E6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DTX4Q9Y2E6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
DTX4Q9Y2E6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DTX4Q9Y2E6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DTX4Q9Y2E6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DTX4Q9Y2E6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DTX4Q9Y2E6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DTX4Q9Y2E6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DTX4Q9Y2E6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DTX4Q9Y2E6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DTX4Q9Y2E6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DTX4Q9Y2E6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DTX4Q9Y2E6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DTX4Q9Y2E6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DTX4Q9Y2E6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DTX4Q9Y2E6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DTX4Q9Y2E6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DTX4Q9Y2E6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DTX4Q9Y2E6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
DTX4Q9Y2E6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DTX4Q9Y2E6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DTX4Q9Y2E6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DTX4Q9Y2E6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DTX4Q9Y2E6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DTX4Q9Y2E6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DTX4Q9Y2E6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DTX4Q9Y2E6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
DTX4Q9Y2E6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DTX4Q9Y2E6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DTX4Q9Y2E6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DTX4Q9Y2E6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DTX4Q9Y2E6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DTX4Q9Y2E6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DTX4Q9Y2E6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DTX4Q9Y2E6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DTX4Q9Y2E6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DTX4Q9Y2E6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DTX4Q9Y2E6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DTX4Q9Y2E6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DTX4Q9Y2E6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DTX4Q9Y2E6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DTX4Q9Y2E6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DTX4Q9Y2E6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DTX4Q9Y2E6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DTX4Q9Y2E6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DTX4Q9Y2E6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DTX4Q9Y2E6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DTX4Q9Y2E6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DTX4Q9Y2E6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DTX4Q9Y2E6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DTX4Q9Y2E6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms