Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SETD1BQ9UPS6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SETD1BQ9UPS6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SETD1BQ9UPS6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SETD1BQ9UPS6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SETD1BQ9UPS6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SETD1BQ9UPS6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SETD1BQ9UPS6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SETD1BQ9UPS6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SETD1BQ9UPS6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
SETD1BQ9UPS6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SETD1BQ9UPS6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
SETD1BQ9UPS6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
SETD1BQ9UPS6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC33.45■■■□□ 2.94
SETD1BQ9UPS6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
SETD1BQ9UPS6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SETD1BQ9UPS6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SETD1BQ9UPS6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SETD1BQ9UPS6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SETD1BQ9UPS6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SETD1BQ9UPS6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SETD1BQ9UPS6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SETD1BQ9UPS6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SETD1BQ9UPS6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SETD1BQ9UPS6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
SETD1BQ9UPS6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SETD1BQ9UPS6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SETD1BQ9UPS6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SETD1BQ9UPS6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SETD1BQ9UPS6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SETD1BQ9UPS6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SETD1BQ9UPS6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SETD1BQ9UPS6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SETD1BQ9UPS6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SETD1BQ9UPS6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SETD1BQ9UPS6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SETD1BQ9UPS6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SETD1BQ9UPS6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SETD1BQ9UPS6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SETD1BQ9UPS6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SETD1BQ9UPS6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SETD1BQ9UPS6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
SETD1BQ9UPS6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SETD1BQ9UPS6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SETD1BQ9UPS6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SETD1BQ9UPS6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SETD1BQ9UPS6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SETD1BQ9UPS6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
SETD1BQ9UPS6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SETD1BQ9UPS6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SETD1BQ9UPS6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SETD1BQ9UPS6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SETD1BQ9UPS6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SETD1BQ9UPS6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SETD1BQ9UPS6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SETD1BQ9UPS6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SETD1BQ9UPS6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SETD1BQ9UPS6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SETD1BQ9UPS6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SETD1BQ9UPS6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SETD1BQ9UPS6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
SETD1BQ9UPS6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SETD1BQ9UPS6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SETD1BQ9UPS6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SETD1BQ9UPS6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SETD1BQ9UPS6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SETD1BQ9UPS6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
SETD1BQ9UPS6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
SETD1BQ9UPS6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SETD1BQ9UPS6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SETD1BQ9UPS6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SETD1BQ9UPS6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SETD1BQ9UPS6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SETD1BQ9UPS6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SETD1BQ9UPS6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SETD1BQ9UPS6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SETD1BQ9UPS6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
SETD1BQ9UPS6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SETD1BQ9UPS6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SETD1BQ9UPS6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SETD1BQ9UPS6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SETD1BQ9UPS6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
SETD1BQ9UPS6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SETD1BQ9UPS6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SETD1BQ9UPS6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SETD1BQ9UPS6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
SETD1BQ9UPS6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SETD1BQ9UPS6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
SETD1BQ9UPS6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SETD1BQ9UPS6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SETD1BQ9UPS6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SETD1BQ9UPS6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SETD1BQ9UPS6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SETD1BQ9UPS6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SETD1BQ9UPS6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SETD1BQ9UPS6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SETD1BQ9UPS6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.93
SETD1BQ9UPS6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.93
SETD1BQ9UPS6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SETD1BQ9UPS6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms