Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN1

CACNG4, Voltage-dependent calcium channel gamma-4 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG4Q9UBN1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNG4Q9UBN1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNG4Q9UBN1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNG4Q9UBN1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNG4Q9UBN1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNG4Q9UBN1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNG4Q9UBN1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNG4Q9UBN1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNG4Q9UBN1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNG4Q9UBN1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNG4Q9UBN1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNG4Q9UBN1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNG4Q9UBN1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNG4Q9UBN1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNG4Q9UBN1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNG4Q9UBN1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNG4Q9UBN1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNG4Q9UBN1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNG4Q9UBN1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNG4Q9UBN1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNG4Q9UBN1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNG4Q9UBN1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNG4Q9UBN1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNG4Q9UBN1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNG4Q9UBN1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNG4Q9UBN1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNG4Q9UBN1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNG4Q9UBN1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNG4Q9UBN1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNG4Q9UBN1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNG4Q9UBN1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNG4Q9UBN1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNG4Q9UBN1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNG4Q9UBN1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNG4Q9UBN1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNG4Q9UBN1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNG4Q9UBN1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNG4Q9UBN1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNG4Q9UBN1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNG4Q9UBN1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNG4Q9UBN1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNG4Q9UBN1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNG4Q9UBN1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNG4Q9UBN1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNG4Q9UBN1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNG4Q9UBN1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNG4Q9UBN1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNG4Q9UBN1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNG4Q9UBN1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNG4Q9UBN1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNG4Q9UBN1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNG4Q9UBN1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNG4Q9UBN1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNG4Q9UBN1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNG4Q9UBN1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNG4Q9UBN1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNG4Q9UBN1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNG4Q9UBN1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNG4Q9UBN1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNG4Q9UBN1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNG4Q9UBN1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNG4Q9UBN1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNG4Q9UBN1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNG4Q9UBN1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNG4Q9UBN1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNG4Q9UBN1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNG4Q9UBN1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNG4Q9UBN1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNG4Q9UBN1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNG4Q9UBN1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNG4Q9UBN1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNG4Q9UBN1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNG4Q9UBN1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNG4Q9UBN1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNG4Q9UBN1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNG4Q9UBN1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNG4Q9UBN1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNG4Q9UBN1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNG4Q9UBN1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNG4Q9UBN1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNG4Q9UBN1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNG4Q9UBN1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNG4Q9UBN1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNG4Q9UBN1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNG4Q9UBN1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNG4Q9UBN1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNG4Q9UBN1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNG4Q9UBN1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNG4Q9UBN1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNG4Q9UBN1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNG4Q9UBN1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNG4Q9UBN1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNG4Q9UBN1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNG4Q9UBN1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNG4Q9UBN1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNG4Q9UBN1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNG4Q9UBN1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNG4Q9UBN1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNG4Q9UBN1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNG4Q9UBN1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms