Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG7

HPS4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS4Q9NQG7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HPS4Q9NQG7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HPS4Q9NQG7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HPS4Q9NQG7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HPS4Q9NQG7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HPS4Q9NQG7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HPS4Q9NQG7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HPS4Q9NQG7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HPS4Q9NQG7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HPS4Q9NQG7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HPS4Q9NQG7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HPS4Q9NQG7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HPS4Q9NQG7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HPS4Q9NQG7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HPS4Q9NQG7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HPS4Q9NQG7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HPS4Q9NQG7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPS4Q9NQG7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPS4Q9NQG7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPS4Q9NQG7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPS4Q9NQG7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPS4Q9NQG7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPS4Q9NQG7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPS4Q9NQG7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPS4Q9NQG7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPS4Q9NQG7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPS4Q9NQG7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPS4Q9NQG7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPS4Q9NQG7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HPS4Q9NQG7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPS4Q9NQG7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPS4Q9NQG7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HPS4Q9NQG7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPS4Q9NQG7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPS4Q9NQG7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPS4Q9NQG7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPS4Q9NQG7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPS4Q9NQG7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPS4Q9NQG7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPS4Q9NQG7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPS4Q9NQG7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPS4Q9NQG7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPS4Q9NQG7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HPS4Q9NQG7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPS4Q9NQG7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HPS4Q9NQG7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HPS4Q9NQG7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HPS4Q9NQG7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HPS4Q9NQG7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HPS4Q9NQG7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HPS4Q9NQG7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HPS4Q9NQG7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HPS4Q9NQG7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HPS4Q9NQG7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HPS4Q9NQG7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HPS4Q9NQG7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HPS4Q9NQG7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HPS4Q9NQG7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HPS4Q9NQG7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HPS4Q9NQG7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HPS4Q9NQG7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HPS4Q9NQG7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HPS4Q9NQG7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPS4Q9NQG7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPS4Q9NQG7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPS4Q9NQG7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPS4Q9NQG7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPS4Q9NQG7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPS4Q9NQG7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HPS4Q9NQG7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HPS4Q9NQG7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HPS4Q9NQG7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HPS4Q9NQG7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HPS4Q9NQG7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HPS4Q9NQG7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HPS4Q9NQG7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HPS4Q9NQG7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HPS4Q9NQG7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HPS4Q9NQG7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HPS4Q9NQG7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HPS4Q9NQG7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPS4Q9NQG7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPS4Q9NQG7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPS4Q9NQG7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPS4Q9NQG7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HPS4Q9NQG7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HPS4Q9NQG7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPS4Q9NQG7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPS4Q9NQG7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPS4Q9NQG7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPS4Q9NQG7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPS4Q9NQG7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPS4Q9NQG7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPS4Q9NQG7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPS4Q9NQG7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPS4Q9NQG7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPS4Q9NQG7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPS4Q9NQG7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPS4Q9NQG7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPS4Q9NQG7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms