Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNHG12Q9BXW3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNHG12Q9BXW3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.1 ms