Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC106Q9BWC9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC106Q9BWC9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC106Q9BWC9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC106Q9BWC9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC106Q9BWC9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC106Q9BWC9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC106Q9BWC9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC106Q9BWC9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC106Q9BWC9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC106Q9BWC9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC106Q9BWC9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC106Q9BWC9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC106Q9BWC9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC106Q9BWC9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC106Q9BWC9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC106Q9BWC9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC106Q9BWC9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC106Q9BWC9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC106Q9BWC9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC106Q9BWC9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC106Q9BWC9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC106Q9BWC9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC106Q9BWC9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC106Q9BWC9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC106Q9BWC9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC106Q9BWC9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC106Q9BWC9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC106Q9BWC9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC106Q9BWC9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC106Q9BWC9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC106Q9BWC9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC106Q9BWC9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC106Q9BWC9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC106Q9BWC9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC106Q9BWC9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC106Q9BWC9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC106Q9BWC9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC106Q9BWC9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC106Q9BWC9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC106Q9BWC9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC106Q9BWC9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC106Q9BWC9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC106Q9BWC9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC106Q9BWC9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC106Q9BWC9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC106Q9BWC9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC106Q9BWC9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC106Q9BWC9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC106Q9BWC9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC106Q9BWC9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC106Q9BWC9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC106Q9BWC9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC106Q9BWC9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC106Q9BWC9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC106Q9BWC9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC106Q9BWC9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC106Q9BWC9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC106Q9BWC9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC106Q9BWC9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC106Q9BWC9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC106Q9BWC9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC106Q9BWC9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC106Q9BWC9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC106Q9BWC9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC106Q9BWC9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC106Q9BWC9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC106Q9BWC9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC106Q9BWC9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC106Q9BWC9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC106Q9BWC9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC106Q9BWC9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC106Q9BWC9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC106Q9BWC9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC106Q9BWC9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC106Q9BWC9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC106Q9BWC9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC106Q9BWC9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC106Q9BWC9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC106Q9BWC9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC106Q9BWC9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC106Q9BWC9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC106Q9BWC9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC106Q9BWC9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC106Q9BWC9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC106Q9BWC9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC106Q9BWC9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC106Q9BWC9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC106Q9BWC9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC106Q9BWC9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC106Q9BWC9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC106Q9BWC9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC106Q9BWC9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC106Q9BWC9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC106Q9BWC9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC106Q9BWC9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC106Q9BWC9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC106Q9BWC9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC106Q9BWC9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC106Q9BWC9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms