Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV99

LRRC61, Leucine-rich repeat-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC61Q9BV99 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC61Q9BV99 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC61Q9BV99 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC61Q9BV99 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC61Q9BV99 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC61Q9BV99 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC61Q9BV99 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC61Q9BV99 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC61Q9BV99 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC61Q9BV99 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC61Q9BV99 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC61Q9BV99 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC61Q9BV99 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC61Q9BV99 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC61Q9BV99 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC61Q9BV99 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC61Q9BV99 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC61Q9BV99 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC61Q9BV99 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC61Q9BV99 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC61Q9BV99 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC61Q9BV99 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC61Q9BV99 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC61Q9BV99 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC61Q9BV99 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC61Q9BV99 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC61Q9BV99 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC61Q9BV99 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC61Q9BV99 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC61Q9BV99 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC61Q9BV99 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC61Q9BV99 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC61Q9BV99 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC61Q9BV99 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC61Q9BV99 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC61Q9BV99 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC61Q9BV99 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC61Q9BV99 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC61Q9BV99 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC61Q9BV99 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC61Q9BV99 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC61Q9BV99 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC61Q9BV99 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC61Q9BV99 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC61Q9BV99 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC61Q9BV99 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC61Q9BV99 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC61Q9BV99 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC61Q9BV99 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC61Q9BV99 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC61Q9BV99 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC61Q9BV99 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC61Q9BV99 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC61Q9BV99 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC61Q9BV99 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC61Q9BV99 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC61Q9BV99 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC61Q9BV99 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC61Q9BV99 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC61Q9BV99 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC61Q9BV99 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC61Q9BV99 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC61Q9BV99 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC61Q9BV99 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC61Q9BV99 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC61Q9BV99 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC61Q9BV99 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC61Q9BV99 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC61Q9BV99 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC61Q9BV99 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC61Q9BV99 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC61Q9BV99 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC61Q9BV99 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC61Q9BV99 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC61Q9BV99 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC61Q9BV99 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC61Q9BV99 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC61Q9BV99 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC61Q9BV99 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC61Q9BV99 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC61Q9BV99 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC61Q9BV99 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC61Q9BV99 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC61Q9BV99 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC61Q9BV99 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC61Q9BV99 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC61Q9BV99 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC61Q9BV99 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC61Q9BV99 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC61Q9BV99 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC61Q9BV99 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC61Q9BV99 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC61Q9BV99 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC61Q9BV99 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC61Q9BV99 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC61Q9BV99 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC61Q9BV99 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC61Q9BV99 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC61Q9BV99 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC61Q9BV99 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms