Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSG0

PRADC1, Protease-associated domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRADC1Q9BSG0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PRADC1Q9BSG0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRADC1Q9BSG0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRADC1Q9BSG0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRADC1Q9BSG0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRADC1Q9BSG0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRADC1Q9BSG0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRADC1Q9BSG0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PRADC1Q9BSG0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRADC1Q9BSG0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRADC1Q9BSG0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRADC1Q9BSG0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRADC1Q9BSG0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRADC1Q9BSG0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRADC1Q9BSG0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRADC1Q9BSG0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms