Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK3

MXRA8, Matrix remodeling-associated protein 8, humanhuman

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MXRA8Q9BRK3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MXRA8Q9BRK3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MXRA8Q9BRK3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MXRA8Q9BRK3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MXRA8Q9BRK3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MXRA8Q9BRK3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MXRA8Q9BRK3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MXRA8Q9BRK3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MXRA8Q9BRK3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MXRA8Q9BRK3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MXRA8Q9BRK3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MXRA8Q9BRK3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MXRA8Q9BRK3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MXRA8Q9BRK3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MXRA8Q9BRK3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MXRA8Q9BRK3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MXRA8Q9BRK3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MXRA8Q9BRK3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MXRA8Q9BRK3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MXRA8Q9BRK3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MXRA8Q9BRK3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MXRA8Q9BRK3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MXRA8Q9BRK3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MXRA8Q9BRK3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MXRA8Q9BRK3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MXRA8Q9BRK3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MXRA8Q9BRK3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MXRA8Q9BRK3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
MXRA8Q9BRK3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MXRA8Q9BRK3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MXRA8Q9BRK3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MXRA8Q9BRK3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MXRA8Q9BRK3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
MXRA8Q9BRK3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
MXRA8Q9BRK3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
MXRA8Q9BRK3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MXRA8Q9BRK3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MXRA8Q9BRK3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MXRA8Q9BRK3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MXRA8Q9BRK3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MXRA8Q9BRK3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MXRA8Q9BRK3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MXRA8Q9BRK3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MXRA8Q9BRK3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MXRA8Q9BRK3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MXRA8Q9BRK3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MXRA8Q9BRK3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MXRA8Q9BRK3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MXRA8Q9BRK3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MXRA8Q9BRK3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MXRA8Q9BRK3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MXRA8Q9BRK3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MXRA8Q9BRK3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MXRA8Q9BRK3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MXRA8Q9BRK3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MXRA8Q9BRK3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MXRA8Q9BRK3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MXRA8Q9BRK3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MXRA8Q9BRK3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MXRA8Q9BRK3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MXRA8Q9BRK3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MXRA8Q9BRK3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MXRA8Q9BRK3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MXRA8Q9BRK3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MXRA8Q9BRK3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MXRA8Q9BRK3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MXRA8Q9BRK3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MXRA8Q9BRK3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MXRA8Q9BRK3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MXRA8Q9BRK3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MXRA8Q9BRK3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MXRA8Q9BRK3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MXRA8Q9BRK3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MXRA8Q9BRK3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MXRA8Q9BRK3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MXRA8Q9BRK3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MXRA8Q9BRK3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MXRA8Q9BRK3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
MXRA8Q9BRK3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MXRA8Q9BRK3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
MXRA8Q9BRK3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
MXRA8Q9BRK3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
MXRA8Q9BRK3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MXRA8Q9BRK3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MXRA8Q9BRK3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MXRA8Q9BRK3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MXRA8Q9BRK3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MXRA8Q9BRK3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MXRA8Q9BRK3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MXRA8Q9BRK3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MXRA8Q9BRK3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MXRA8Q9BRK3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MXRA8Q9BRK3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MXRA8Q9BRK3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MXRA8Q9BRK3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MXRA8Q9BRK3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MXRA8Q9BRK3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MXRA8Q9BRK3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MXRA8Q9BRK3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MXRA8Q9BRK3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
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