Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG2

SH2D3A, SH2 domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D3AQ9BRG2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH2D3AQ9BRG2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SH2D3AQ9BRG2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SH2D3AQ9BRG2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SH2D3AQ9BRG2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SH2D3AQ9BRG2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SH2D3AQ9BRG2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SH2D3AQ9BRG2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SH2D3AQ9BRG2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SH2D3AQ9BRG2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SH2D3AQ9BRG2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SH2D3AQ9BRG2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SH2D3AQ9BRG2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SH2D3AQ9BRG2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SH2D3AQ9BRG2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SH2D3AQ9BRG2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SH2D3AQ9BRG2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SH2D3AQ9BRG2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SH2D3AQ9BRG2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SH2D3AQ9BRG2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SH2D3AQ9BRG2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SH2D3AQ9BRG2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH2D3AQ9BRG2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH2D3AQ9BRG2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH2D3AQ9BRG2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH2D3AQ9BRG2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH2D3AQ9BRG2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH2D3AQ9BRG2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH2D3AQ9BRG2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH2D3AQ9BRG2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH2D3AQ9BRG2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH2D3AQ9BRG2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH2D3AQ9BRG2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH2D3AQ9BRG2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH2D3AQ9BRG2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SH2D3AQ9BRG2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SH2D3AQ9BRG2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SH2D3AQ9BRG2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SH2D3AQ9BRG2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SH2D3AQ9BRG2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SH2D3AQ9BRG2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SH2D3AQ9BRG2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SH2D3AQ9BRG2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SH2D3AQ9BRG2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SH2D3AQ9BRG2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SH2D3AQ9BRG2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SH2D3AQ9BRG2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SH2D3AQ9BRG2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SH2D3AQ9BRG2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SH2D3AQ9BRG2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SH2D3AQ9BRG2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SH2D3AQ9BRG2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SH2D3AQ9BRG2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SH2D3AQ9BRG2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SH2D3AQ9BRG2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SH2D3AQ9BRG2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SH2D3AQ9BRG2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SH2D3AQ9BRG2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SH2D3AQ9BRG2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SH2D3AQ9BRG2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SH2D3AQ9BRG2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SH2D3AQ9BRG2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SH2D3AQ9BRG2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SH2D3AQ9BRG2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SH2D3AQ9BRG2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SH2D3AQ9BRG2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SH2D3AQ9BRG2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SH2D3AQ9BRG2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SH2D3AQ9BRG2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SH2D3AQ9BRG2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SH2D3AQ9BRG2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SH2D3AQ9BRG2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SH2D3AQ9BRG2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SH2D3AQ9BRG2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SH2D3AQ9BRG2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SH2D3AQ9BRG2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SH2D3AQ9BRG2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SH2D3AQ9BRG2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SH2D3AQ9BRG2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SH2D3AQ9BRG2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SH2D3AQ9BRG2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SH2D3AQ9BRG2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SH2D3AQ9BRG2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SH2D3AQ9BRG2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SH2D3AQ9BRG2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SH2D3AQ9BRG2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SH2D3AQ9BRG2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SH2D3AQ9BRG2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SH2D3AQ9BRG2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SH2D3AQ9BRG2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SH2D3AQ9BRG2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SH2D3AQ9BRG2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SH2D3AQ9BRG2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SH2D3AQ9BRG2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SH2D3AQ9BRG2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SH2D3AQ9BRG2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SH2D3AQ9BRG2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SH2D3AQ9BRG2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SH2D3AQ9BRG2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SH2D3AQ9BRG2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms