Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ65

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USB1Q9BQ65 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USB1Q9BQ65 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USB1Q9BQ65 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USB1Q9BQ65 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USB1Q9BQ65 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USB1Q9BQ65 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USB1Q9BQ65 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USB1Q9BQ65 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USB1Q9BQ65 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USB1Q9BQ65 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USB1Q9BQ65 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USB1Q9BQ65 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
USB1Q9BQ65 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USB1Q9BQ65 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USB1Q9BQ65 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USB1Q9BQ65 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USB1Q9BQ65 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USB1Q9BQ65 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USB1Q9BQ65 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USB1Q9BQ65 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USB1Q9BQ65 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USB1Q9BQ65 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USB1Q9BQ65 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USB1Q9BQ65 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USB1Q9BQ65 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USB1Q9BQ65 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USB1Q9BQ65 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USB1Q9BQ65 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USB1Q9BQ65 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USB1Q9BQ65 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USB1Q9BQ65 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USB1Q9BQ65 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USB1Q9BQ65 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USB1Q9BQ65 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USB1Q9BQ65 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USB1Q9BQ65 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USB1Q9BQ65 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USB1Q9BQ65 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USB1Q9BQ65 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USB1Q9BQ65 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USB1Q9BQ65 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USB1Q9BQ65 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USB1Q9BQ65 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USB1Q9BQ65 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
USB1Q9BQ65 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USB1Q9BQ65 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USB1Q9BQ65 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USB1Q9BQ65 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USB1Q9BQ65 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USB1Q9BQ65 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USB1Q9BQ65 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USB1Q9BQ65 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USB1Q9BQ65 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USB1Q9BQ65 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USB1Q9BQ65 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USB1Q9BQ65 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USB1Q9BQ65 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USB1Q9BQ65 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USB1Q9BQ65 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USB1Q9BQ65 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USB1Q9BQ65 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USB1Q9BQ65 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USB1Q9BQ65 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USB1Q9BQ65 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USB1Q9BQ65 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USB1Q9BQ65 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USB1Q9BQ65 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USB1Q9BQ65 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USB1Q9BQ65 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USB1Q9BQ65 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USB1Q9BQ65 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USB1Q9BQ65 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USB1Q9BQ65 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USB1Q9BQ65 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USB1Q9BQ65 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USB1Q9BQ65 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USB1Q9BQ65 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USB1Q9BQ65 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USB1Q9BQ65 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USB1Q9BQ65 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USB1Q9BQ65 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USB1Q9BQ65 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USB1Q9BQ65 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
USB1Q9BQ65 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USB1Q9BQ65 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USB1Q9BQ65 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USB1Q9BQ65 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USB1Q9BQ65 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USB1Q9BQ65 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
USB1Q9BQ65 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USB1Q9BQ65 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
USB1Q9BQ65 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USB1Q9BQ65 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USB1Q9BQ65 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USB1Q9BQ65 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USB1Q9BQ65 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USB1Q9BQ65 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USB1Q9BQ65 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USB1Q9BQ65 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USB1Q9BQ65 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms