Protein–RNA interactions for Protein: Q99961

SH3GL1, Endophilin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL1Q99961 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3GL1Q99961 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3GL1Q99961 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3GL1Q99961 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3GL1Q99961 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3GL1Q99961 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3GL1Q99961 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3GL1Q99961 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SH3GL1Q99961 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SH3GL1Q99961 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SH3GL1Q99961 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SH3GL1Q99961 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SH3GL1Q99961 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SH3GL1Q99961 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SH3GL1Q99961 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SH3GL1Q99961 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SH3GL1Q99961 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SH3GL1Q99961 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SH3GL1Q99961 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SH3GL1Q99961 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3GL1Q99961 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3GL1Q99961 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3GL1Q99961 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3GL1Q99961 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3GL1Q99961 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3GL1Q99961 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3GL1Q99961 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3GL1Q99961 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3GL1Q99961 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3GL1Q99961 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3GL1Q99961 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3GL1Q99961 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3GL1Q99961 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3GL1Q99961 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3GL1Q99961 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3GL1Q99961 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3GL1Q99961 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3GL1Q99961 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3GL1Q99961 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3GL1Q99961 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3GL1Q99961 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3GL1Q99961 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3GL1Q99961 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3GL1Q99961 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3GL1Q99961 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3GL1Q99961 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3GL1Q99961 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3GL1Q99961 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3GL1Q99961 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3GL1Q99961 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3GL1Q99961 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3GL1Q99961 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3GL1Q99961 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3GL1Q99961 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3GL1Q99961 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3GL1Q99961 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3GL1Q99961 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3GL1Q99961 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3GL1Q99961 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3GL1Q99961 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3GL1Q99961 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3GL1Q99961 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3GL1Q99961 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3GL1Q99961 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3GL1Q99961 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3GL1Q99961 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3GL1Q99961 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3GL1Q99961 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3GL1Q99961 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3GL1Q99961 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3GL1Q99961 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SH3GL1Q99961 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SH3GL1Q99961 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SH3GL1Q99961 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SH3GL1Q99961 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SH3GL1Q99961 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SH3GL1Q99961 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SH3GL1Q99961 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SH3GL1Q99961 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SH3GL1Q99961 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SH3GL1Q99961 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SH3GL1Q99961 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SH3GL1Q99961 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SH3GL1Q99961 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SH3GL1Q99961 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SH3GL1Q99961 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SH3GL1Q99961 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SH3GL1Q99961 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SH3GL1Q99961 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SH3GL1Q99961 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SH3GL1Q99961 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SH3GL1Q99961 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SH3GL1Q99961 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SH3GL1Q99961 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SH3GL1Q99961 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SH3GL1Q99961 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SH3GL1Q99961 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SH3GL1Q99961 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SH3GL1Q99961 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SH3GL1Q99961 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms