Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMAD5Q99717 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMAD5Q99717 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAD5Q99717 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAD5Q99717 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAD5Q99717 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAD5Q99717 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAD5Q99717 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAD5Q99717 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAD5Q99717 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAD5Q99717 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAD5Q99717 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAD5Q99717 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAD5Q99717 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAD5Q99717 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMAD5Q99717 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SMAD5Q99717 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMAD5Q99717 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMAD5Q99717 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAD5Q99717 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAD5Q99717 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAD5Q99717 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAD5Q99717 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAD5Q99717 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAD5Q99717 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAD5Q99717 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAD5Q99717 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAD5Q99717 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAD5Q99717 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAD5Q99717 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAD5Q99717 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAD5Q99717 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD5Q99717 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD5Q99717 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD5Q99717 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD5Q99717 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD5Q99717 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD5Q99717 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD5Q99717 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD5Q99717 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD5Q99717 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD5Q99717 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD5Q99717 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD5Q99717 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD5Q99717 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD5Q99717 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD5Q99717 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAD5Q99717 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAD5Q99717 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAD5Q99717 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAD5Q99717 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAD5Q99717 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAD5Q99717 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAD5Q99717 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAD5Q99717 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAD5Q99717 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD5Q99717 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD5Q99717 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD5Q99717 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD5Q99717 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD5Q99717 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD5Q99717 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD5Q99717 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMAD5Q99717 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMAD5Q99717 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMAD5Q99717 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMAD5Q99717 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMAD5Q99717 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMAD5Q99717 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMAD5Q99717 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMAD5Q99717 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMAD5Q99717 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMAD5Q99717 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SMAD5Q99717 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMAD5Q99717 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMAD5Q99717 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD5Q99717 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD5Q99717 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD5Q99717 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SMAD5Q99717 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD5Q99717 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD5Q99717 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD5Q99717 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD5Q99717 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD5Q99717 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD5Q99717 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD5Q99717 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SMAD5Q99717 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD5Q99717 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD5Q99717 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD5Q99717 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD5Q99717 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD5Q99717 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD5Q99717 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD5Q99717 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD5Q99717 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SMAD5Q99717 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SMAD5Q99717 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD5Q99717 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SMAD5Q99717 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms