Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NUDCD1Q96RS6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUDCD1Q96RS6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NUDCD1Q96RS6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NUDCD1Q96RS6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NUDCD1Q96RS6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUDCD1Q96RS6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUDCD1Q96RS6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUDCD1Q96RS6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUDCD1Q96RS6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUDCD1Q96RS6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUDCD1Q96RS6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NUDCD1Q96RS6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUDCD1Q96RS6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUDCD1Q96RS6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUDCD1Q96RS6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUDCD1Q96RS6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUDCD1Q96RS6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUDCD1Q96RS6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUDCD1Q96RS6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUDCD1Q96RS6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUDCD1Q96RS6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUDCD1Q96RS6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms