Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PHF12Q96QT6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF12Q96QT6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF12Q96QT6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF12Q96QT6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF12Q96QT6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF12Q96QT6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF12Q96QT6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF12Q96QT6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF12Q96QT6 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF12Q96QT6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF12Q96QT6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF12Q96QT6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF12Q96QT6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF12Q96QT6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF12Q96QT6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF12Q96QT6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF12Q96QT6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF12Q96QT6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF12Q96QT6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF12Q96QT6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF12Q96QT6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF12Q96QT6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF12Q96QT6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF12Q96QT6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF12Q96QT6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF12Q96QT6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF12Q96QT6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF12Q96QT6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF12Q96QT6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF12Q96QT6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF12Q96QT6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PHF12Q96QT6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PHF12Q96QT6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PHF12Q96QT6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHF12Q96QT6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHF12Q96QT6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHF12Q96QT6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHF12Q96QT6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHF12Q96QT6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHF12Q96QT6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHF12Q96QT6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHF12Q96QT6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHF12Q96QT6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHF12Q96QT6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHF12Q96QT6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHF12Q96QT6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHF12Q96QT6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PHF12Q96QT6 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHF12Q96QT6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHF12Q96QT6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHF12Q96QT6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHF12Q96QT6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHF12Q96QT6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHF12Q96QT6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHF12Q96QT6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHF12Q96QT6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHF12Q96QT6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHF12Q96QT6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHF12Q96QT6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PHF12Q96QT6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHF12Q96QT6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHF12Q96QT6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHF12Q96QT6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHF12Q96QT6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHF12Q96QT6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHF12Q96QT6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHF12Q96QT6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHF12Q96QT6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF12Q96QT6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF12Q96QT6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF12Q96QT6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF12Q96QT6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF12Q96QT6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF12Q96QT6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF12Q96QT6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF12Q96QT6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF12Q96QT6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF12Q96QT6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF12Q96QT6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF12Q96QT6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF12Q96QT6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF12Q96QT6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF12Q96QT6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF12Q96QT6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF12Q96QT6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF12Q96QT6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHF12Q96QT6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHF12Q96QT6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHF12Q96QT6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHF12Q96QT6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHF12Q96QT6 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PHF12Q96QT6 AC008686.1-203ENST00000591826 463 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHF12Q96QT6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHF12Q96QT6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHF12Q96QT6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHF12Q96QT6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHF12Q96QT6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHF12Q96QT6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHF12Q96QT6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 297 ms