Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PRRC1Q96M27 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRRC1Q96M27 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PRRC1Q96M27 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRRC1Q96M27 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRRC1Q96M27 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRRC1Q96M27 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRRC1Q96M27 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PRRC1Q96M27 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PRRC1Q96M27 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PRRC1Q96M27 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PRRC1Q96M27 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PRRC1Q96M27 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PRRC1Q96M27 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PRRC1Q96M27 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PRRC1Q96M27 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PRRC1Q96M27 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PRRC1Q96M27 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PRRC1Q96M27 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRRC1Q96M27 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRRC1Q96M27 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.5 ms