Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SAMD8Q96LT4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SAMD8Q96LT4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SAMD8Q96LT4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SAMD8Q96LT4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SAMD8Q96LT4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SAMD8Q96LT4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SAMD8Q96LT4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SAMD8Q96LT4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SAMD8Q96LT4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SAMD8Q96LT4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SAMD8Q96LT4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SAMD8Q96LT4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SAMD8Q96LT4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SAMD8Q96LT4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SAMD8Q96LT4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SAMD8Q96LT4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SAMD8Q96LT4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SAMD8Q96LT4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SAMD8Q96LT4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SAMD8Q96LT4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SAMD8Q96LT4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SAMD8Q96LT4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SAMD8Q96LT4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SAMD8Q96LT4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SAMD8Q96LT4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SAMD8Q96LT4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SAMD8Q96LT4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SAMD8Q96LT4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SAMD8Q96LT4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SAMD8Q96LT4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SAMD8Q96LT4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SAMD8Q96LT4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SAMD8Q96LT4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SAMD8Q96LT4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SAMD8Q96LT4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SAMD8Q96LT4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SAMD8Q96LT4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SAMD8Q96LT4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SAMD8Q96LT4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SAMD8Q96LT4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
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SAMD8Q96LT4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SAMD8Q96LT4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SAMD8Q96LT4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SAMD8Q96LT4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SAMD8Q96LT4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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SAMD8Q96LT4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SAMD8Q96LT4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SAMD8Q96LT4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SAMD8Q96LT4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SAMD8Q96LT4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SAMD8Q96LT4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SAMD8Q96LT4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SAMD8Q96LT4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SAMD8Q96LT4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SAMD8Q96LT4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SAMD8Q96LT4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SAMD8Q96LT4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SAMD8Q96LT4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SAMD8Q96LT4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SAMD8Q96LT4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SAMD8Q96LT4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SAMD8Q96LT4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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