Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNB6

NFXL1, NF-X1-type zinc finger protein NFXL1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFXL1Q6ZNB6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFXL1Q6ZNB6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFXL1Q6ZNB6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFXL1Q6ZNB6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NFXL1Q6ZNB6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFXL1Q6ZNB6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFXL1Q6ZNB6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFXL1Q6ZNB6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFXL1Q6ZNB6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFXL1Q6ZNB6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFXL1Q6ZNB6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFXL1Q6ZNB6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFXL1Q6ZNB6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NFXL1Q6ZNB6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NFXL1Q6ZNB6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NFXL1Q6ZNB6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NFXL1Q6ZNB6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NFXL1Q6ZNB6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NFXL1Q6ZNB6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NFXL1Q6ZNB6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NFXL1Q6ZNB6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NFXL1Q6ZNB6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NFXL1Q6ZNB6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NFXL1Q6ZNB6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NFXL1Q6ZNB6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NFXL1Q6ZNB6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NFXL1Q6ZNB6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NFXL1Q6ZNB6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NFXL1Q6ZNB6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
NFXL1Q6ZNB6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
NFXL1Q6ZNB6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NFXL1Q6ZNB6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NFXL1Q6ZNB6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NFXL1Q6ZNB6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NFXL1Q6ZNB6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NFXL1Q6ZNB6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NFXL1Q6ZNB6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NFXL1Q6ZNB6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NFXL1Q6ZNB6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NFXL1Q6ZNB6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NFXL1Q6ZNB6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NFXL1Q6ZNB6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NFXL1Q6ZNB6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NFXL1Q6ZNB6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NFXL1Q6ZNB6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NFXL1Q6ZNB6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NFXL1Q6ZNB6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NFXL1Q6ZNB6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NFXL1Q6ZNB6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NFXL1Q6ZNB6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NFXL1Q6ZNB6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NFXL1Q6ZNB6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NFXL1Q6ZNB6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NFXL1Q6ZNB6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NFXL1Q6ZNB6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NFXL1Q6ZNB6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NFXL1Q6ZNB6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NFXL1Q6ZNB6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NFXL1Q6ZNB6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NFXL1Q6ZNB6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NFXL1Q6ZNB6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NFXL1Q6ZNB6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NFXL1Q6ZNB6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NFXL1Q6ZNB6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NFXL1Q6ZNB6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NFXL1Q6ZNB6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NFXL1Q6ZNB6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NFXL1Q6ZNB6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NFXL1Q6ZNB6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NFXL1Q6ZNB6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NFXL1Q6ZNB6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NFXL1Q6ZNB6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NFXL1Q6ZNB6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NFXL1Q6ZNB6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NFXL1Q6ZNB6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NFXL1Q6ZNB6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NFXL1Q6ZNB6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NFXL1Q6ZNB6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NFXL1Q6ZNB6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NFXL1Q6ZNB6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NFXL1Q6ZNB6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NFXL1Q6ZNB6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NFXL1Q6ZNB6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NFXL1Q6ZNB6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NFXL1Q6ZNB6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NFXL1Q6ZNB6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NFXL1Q6ZNB6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NFXL1Q6ZNB6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NFXL1Q6ZNB6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NFXL1Q6ZNB6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NFXL1Q6ZNB6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NFXL1Q6ZNB6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NFXL1Q6ZNB6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NFXL1Q6ZNB6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NFXL1Q6ZNB6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NFXL1Q6ZNB6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NFXL1Q6ZNB6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NFXL1Q6ZNB6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NFXL1Q6ZNB6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NFXL1Q6ZNB6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms