Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOXD4L3Q6VB84 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOXD4L3Q6VB84 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOXD4L3Q6VB84 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
FOXD4L3Q6VB84 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOXD4L3Q6VB84 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOXD4L3Q6VB84 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOXD4L3Q6VB84 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FOXD4L3Q6VB84 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FOXD4L3Q6VB84 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FOXD4L3Q6VB84 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
FOXD4L3Q6VB84 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FOXD4L3Q6VB84 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FOXD4L3Q6VB84 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FOXD4L3Q6VB84 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FOXD4L3Q6VB84 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FOXD4L3Q6VB84 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FOXD4L3Q6VB84 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FOXD4L3Q6VB84 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
FOXD4L3Q6VB84 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FOXD4L3Q6VB84 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
FOXD4L3Q6VB84 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FOXD4L3Q6VB84 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FOXD4L3Q6VB84 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FOXD4L3Q6VB84 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FOXD4L3Q6VB84 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FOXD4L3Q6VB84 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FOXD4L3Q6VB84 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FOXD4L3Q6VB84 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FOXD4L3Q6VB84 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
FOXD4L3Q6VB84 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FOXD4L3Q6VB84 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
FOXD4L3Q6VB84 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FOXD4L3Q6VB84 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FOXD4L3Q6VB84 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOXD4L3Q6VB84 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOXD4L3Q6VB84 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOXD4L3Q6VB84 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOXD4L3Q6VB84 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOXD4L3Q6VB84 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOXD4L3Q6VB84 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOXD4L3Q6VB84 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOXD4L3Q6VB84 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOXD4L3Q6VB84 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
FOXD4L3Q6VB84 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FOXD4L3Q6VB84 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FOXD4L3Q6VB84 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FOXD4L3Q6VB84 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FOXD4L3Q6VB84 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FOXD4L3Q6VB84 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FOXD4L3Q6VB84 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FOXD4L3Q6VB84 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOXD4L3Q6VB84 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOXD4L3Q6VB84 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOXD4L3Q6VB84 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOXD4L3Q6VB84 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOXD4L3Q6VB84 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOXD4L3Q6VB84 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOXD4L3Q6VB84 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOXD4L3Q6VB84 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOXD4L3Q6VB84 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOXD4L3Q6VB84 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXD4L3Q6VB84 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXD4L3Q6VB84 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXD4L3Q6VB84 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXD4L3Q6VB84 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXD4L3Q6VB84 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXD4L3Q6VB84 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXD4L3Q6VB84 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXD4L3Q6VB84 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXD4L3Q6VB84 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXD4L3Q6VB84 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXD4L3Q6VB84 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXD4L3Q6VB84 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXD4L3Q6VB84 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXD4L3Q6VB84 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXD4L3Q6VB84 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXD4L3Q6VB84 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXD4L3Q6VB84 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXD4L3Q6VB84 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXD4L3Q6VB84 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXD4L3Q6VB84 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXD4L3Q6VB84 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXD4L3Q6VB84 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXD4L3Q6VB84 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXD4L3Q6VB84 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXD4L3Q6VB84 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXD4L3Q6VB84 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXD4L3Q6VB84 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXD4L3Q6VB84 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXD4L3Q6VB84 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXD4L3Q6VB84 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXD4L3Q6VB84 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXD4L3Q6VB84 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXD4L3Q6VB84 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXD4L3Q6VB84 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXD4L3Q6VB84 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXD4L3Q6VB84 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXD4L3Q6VB84 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXD4L3Q6VB84 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146 ms