Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2M8

PNCK, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1B, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNCKQ6P2M8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNCKQ6P2M8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNCKQ6P2M8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNCKQ6P2M8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNCKQ6P2M8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNCKQ6P2M8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNCKQ6P2M8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNCKQ6P2M8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNCKQ6P2M8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNCKQ6P2M8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNCKQ6P2M8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNCKQ6P2M8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNCKQ6P2M8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNCKQ6P2M8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PNCKQ6P2M8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNCKQ6P2M8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PNCKQ6P2M8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PNCKQ6P2M8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PNCKQ6P2M8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PNCKQ6P2M8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNCKQ6P2M8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNCKQ6P2M8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNCKQ6P2M8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNCKQ6P2M8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNCKQ6P2M8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNCKQ6P2M8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNCKQ6P2M8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNCKQ6P2M8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNCKQ6P2M8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNCKQ6P2M8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNCKQ6P2M8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNCKQ6P2M8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNCKQ6P2M8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNCKQ6P2M8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNCKQ6P2M8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PNCKQ6P2M8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNCKQ6P2M8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNCKQ6P2M8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNCKQ6P2M8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNCKQ6P2M8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNCKQ6P2M8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNCKQ6P2M8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNCKQ6P2M8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNCKQ6P2M8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNCKQ6P2M8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNCKQ6P2M8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNCKQ6P2M8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNCKQ6P2M8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNCKQ6P2M8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNCKQ6P2M8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNCKQ6P2M8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNCKQ6P2M8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PNCKQ6P2M8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNCKQ6P2M8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNCKQ6P2M8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNCKQ6P2M8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNCKQ6P2M8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNCKQ6P2M8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNCKQ6P2M8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNCKQ6P2M8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNCKQ6P2M8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNCKQ6P2M8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNCKQ6P2M8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNCKQ6P2M8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNCKQ6P2M8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNCKQ6P2M8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNCKQ6P2M8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNCKQ6P2M8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNCKQ6P2M8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNCKQ6P2M8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNCKQ6P2M8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNCKQ6P2M8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PNCKQ6P2M8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PNCKQ6P2M8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PNCKQ6P2M8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PNCKQ6P2M8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNCKQ6P2M8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNCKQ6P2M8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNCKQ6P2M8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PNCKQ6P2M8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNCKQ6P2M8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNCKQ6P2M8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNCKQ6P2M8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNCKQ6P2M8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNCKQ6P2M8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNCKQ6P2M8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNCKQ6P2M8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNCKQ6P2M8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNCKQ6P2M8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNCKQ6P2M8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNCKQ6P2M8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNCKQ6P2M8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNCKQ6P2M8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNCKQ6P2M8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNCKQ6P2M8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNCKQ6P2M8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PNCKQ6P2M8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNCKQ6P2M8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNCKQ6P2M8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNCKQ6P2M8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.6 ms