Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LETMD1Q6P1Q0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LETMD1Q6P1Q0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LETMD1Q6P1Q0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LETMD1Q6P1Q0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LETMD1Q6P1Q0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LETMD1Q6P1Q0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LETMD1Q6P1Q0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LETMD1Q6P1Q0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LETMD1Q6P1Q0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LETMD1Q6P1Q0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LETMD1Q6P1Q0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LETMD1Q6P1Q0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LETMD1Q6P1Q0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LETMD1Q6P1Q0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LETMD1Q6P1Q0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LETMD1Q6P1Q0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LETMD1Q6P1Q0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LETMD1Q6P1Q0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LETMD1Q6P1Q0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LETMD1Q6P1Q0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LETMD1Q6P1Q0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LETMD1Q6P1Q0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LETMD1Q6P1Q0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LETMD1Q6P1Q0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LETMD1Q6P1Q0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LETMD1Q6P1Q0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LETMD1Q6P1Q0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LETMD1Q6P1Q0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LETMD1Q6P1Q0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LETMD1Q6P1Q0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LETMD1Q6P1Q0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LETMD1Q6P1Q0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LETMD1Q6P1Q0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LETMD1Q6P1Q0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LETMD1Q6P1Q0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LETMD1Q6P1Q0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LETMD1Q6P1Q0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LETMD1Q6P1Q0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LETMD1Q6P1Q0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LETMD1Q6P1Q0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LETMD1Q6P1Q0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LETMD1Q6P1Q0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LETMD1Q6P1Q0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LETMD1Q6P1Q0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LETMD1Q6P1Q0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LETMD1Q6P1Q0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LETMD1Q6P1Q0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LETMD1Q6P1Q0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LETMD1Q6P1Q0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LETMD1Q6P1Q0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LETMD1Q6P1Q0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LETMD1Q6P1Q0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LETMD1Q6P1Q0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LETMD1Q6P1Q0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LETMD1Q6P1Q0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LETMD1Q6P1Q0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LETMD1Q6P1Q0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LETMD1Q6P1Q0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LETMD1Q6P1Q0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LETMD1Q6P1Q0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LETMD1Q6P1Q0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LETMD1Q6P1Q0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LETMD1Q6P1Q0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LETMD1Q6P1Q0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LETMD1Q6P1Q0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LETMD1Q6P1Q0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LETMD1Q6P1Q0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LETMD1Q6P1Q0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LETMD1Q6P1Q0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LETMD1Q6P1Q0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LETMD1Q6P1Q0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LETMD1Q6P1Q0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LETMD1Q6P1Q0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LETMD1Q6P1Q0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LETMD1Q6P1Q0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LETMD1Q6P1Q0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LETMD1Q6P1Q0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
LETMD1Q6P1Q0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LETMD1Q6P1Q0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LETMD1Q6P1Q0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LETMD1Q6P1Q0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LETMD1Q6P1Q0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LETMD1Q6P1Q0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LETMD1Q6P1Q0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LETMD1Q6P1Q0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LETMD1Q6P1Q0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LETMD1Q6P1Q0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LETMD1Q6P1Q0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LETMD1Q6P1Q0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LETMD1Q6P1Q0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LETMD1Q6P1Q0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LETMD1Q6P1Q0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LETMD1Q6P1Q0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LETMD1Q6P1Q0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LETMD1Q6P1Q0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LETMD1Q6P1Q0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LETMD1Q6P1Q0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LETMD1Q6P1Q0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LETMD1Q6P1Q0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms