Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N5

PROX2, Prospero homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX2Q3B8N5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PROX2Q3B8N5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PROX2Q3B8N5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PROX2Q3B8N5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PROX2Q3B8N5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PROX2Q3B8N5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PROX2Q3B8N5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PROX2Q3B8N5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PROX2Q3B8N5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PROX2Q3B8N5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PROX2Q3B8N5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PROX2Q3B8N5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PROX2Q3B8N5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PROX2Q3B8N5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PROX2Q3B8N5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PROX2Q3B8N5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PROX2Q3B8N5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PROX2Q3B8N5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PROX2Q3B8N5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PROX2Q3B8N5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PROX2Q3B8N5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PROX2Q3B8N5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PROX2Q3B8N5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PROX2Q3B8N5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PROX2Q3B8N5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PROX2Q3B8N5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PROX2Q3B8N5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PROX2Q3B8N5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PROX2Q3B8N5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PROX2Q3B8N5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PROX2Q3B8N5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PROX2Q3B8N5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PROX2Q3B8N5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PROX2Q3B8N5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PROX2Q3B8N5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PROX2Q3B8N5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PROX2Q3B8N5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PROX2Q3B8N5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PROX2Q3B8N5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PROX2Q3B8N5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PROX2Q3B8N5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PROX2Q3B8N5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PROX2Q3B8N5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PROX2Q3B8N5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PROX2Q3B8N5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PROX2Q3B8N5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PROX2Q3B8N5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PROX2Q3B8N5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PROX2Q3B8N5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PROX2Q3B8N5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PROX2Q3B8N5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PROX2Q3B8N5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PROX2Q3B8N5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PROX2Q3B8N5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PROX2Q3B8N5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PROX2Q3B8N5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PROX2Q3B8N5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PROX2Q3B8N5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PROX2Q3B8N5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PROX2Q3B8N5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PROX2Q3B8N5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PROX2Q3B8N5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PROX2Q3B8N5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PROX2Q3B8N5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PROX2Q3B8N5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PROX2Q3B8N5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PROX2Q3B8N5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PROX2Q3B8N5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PROX2Q3B8N5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PROX2Q3B8N5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PROX2Q3B8N5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PROX2Q3B8N5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PROX2Q3B8N5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PROX2Q3B8N5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PROX2Q3B8N5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PROX2Q3B8N5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PROX2Q3B8N5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PROX2Q3B8N5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PROX2Q3B8N5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PROX2Q3B8N5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PROX2Q3B8N5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PROX2Q3B8N5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PROX2Q3B8N5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PROX2Q3B8N5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PROX2Q3B8N5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PROX2Q3B8N5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PROX2Q3B8N5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PROX2Q3B8N5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PROX2Q3B8N5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PROX2Q3B8N5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PROX2Q3B8N5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PROX2Q3B8N5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PROX2Q3B8N5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PROX2Q3B8N5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PROX2Q3B8N5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PROX2Q3B8N5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PROX2Q3B8N5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PROX2Q3B8N5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PROX2Q3B8N5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PROX2Q3B8N5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms