Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTF1Q16619 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CTF1Q16619 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTF1Q16619 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTF1Q16619 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTF1Q16619 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTF1Q16619 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTF1Q16619 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTF1Q16619 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTF1Q16619 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTF1Q16619 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTF1Q16619 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTF1Q16619 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTF1Q16619 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTF1Q16619 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTF1Q16619 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CTF1Q16619 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTF1Q16619 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTF1Q16619 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTF1Q16619 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTF1Q16619 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTF1Q16619 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTF1Q16619 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTF1Q16619 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTF1Q16619 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTF1Q16619 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTF1Q16619 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTF1Q16619 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTF1Q16619 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTF1Q16619 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTF1Q16619 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTF1Q16619 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTF1Q16619 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTF1Q16619 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTF1Q16619 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTF1Q16619 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTF1Q16619 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTF1Q16619 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTF1Q16619 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTF1Q16619 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTF1Q16619 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTF1Q16619 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTF1Q16619 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTF1Q16619 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTF1Q16619 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTF1Q16619 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTF1Q16619 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTF1Q16619 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTF1Q16619 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTF1Q16619 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTF1Q16619 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTF1Q16619 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTF1Q16619 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CTF1Q16619 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTF1Q16619 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTF1Q16619 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTF1Q16619 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTF1Q16619 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTF1Q16619 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTF1Q16619 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTF1Q16619 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTF1Q16619 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTF1Q16619 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTF1Q16619 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CTF1Q16619 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTF1Q16619 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTF1Q16619 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTF1Q16619 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CTF1Q16619 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTF1Q16619 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTF1Q16619 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTF1Q16619 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTF1Q16619 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTF1Q16619 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTF1Q16619 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTF1Q16619 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTF1Q16619 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTF1Q16619 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTF1Q16619 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTF1Q16619 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTF1Q16619 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CTF1Q16619 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTF1Q16619 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTF1Q16619 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTF1Q16619 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTF1Q16619 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CTF1Q16619 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CTF1Q16619 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CTF1Q16619 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTF1Q16619 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTF1Q16619 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CTF1Q16619 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTF1Q16619 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTF1Q16619 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTF1Q16619 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTF1Q16619 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTF1Q16619 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTF1Q16619 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTF1Q16619 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTF1Q16619 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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