Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
EEA1Q15075 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
EEA1Q15075 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
EEA1Q15075 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
EEA1Q15075 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
EEA1Q15075 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
EEA1Q15075 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
EEA1Q15075 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
EEA1Q15075 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
EEA1Q15075 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
EEA1Q15075 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
EEA1Q15075 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
EEA1Q15075 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
EEA1Q15075 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
EEA1Q15075 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
EEA1Q15075 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
EEA1Q15075 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
EEA1Q15075 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
EEA1Q15075 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
EEA1Q15075 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
EEA1Q15075 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
EEA1Q15075 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
EEA1Q15075 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
EEA1Q15075 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
EEA1Q15075 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
EEA1Q15075 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
EEA1Q15075 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
EEA1Q15075 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
EEA1Q15075 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
EEA1Q15075 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC37.58■■■■□ 3.61
EEA1Q15075 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
EEA1Q15075 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
EEA1Q15075 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
EEA1Q15075 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
EEA1Q15075 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
EEA1Q15075 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
EEA1Q15075 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
EEA1Q15075 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
EEA1Q15075 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
EEA1Q15075 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
EEA1Q15075 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
EEA1Q15075 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
EEA1Q15075 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
EEA1Q15075 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
EEA1Q15075 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
EEA1Q15075 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
EEA1Q15075 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
EEA1Q15075 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
EEA1Q15075 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
EEA1Q15075 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
EEA1Q15075 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
EEA1Q15075 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
EEA1Q15075 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
EEA1Q15075 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
EEA1Q15075 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
EEA1Q15075 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
EEA1Q15075 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
EEA1Q15075 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
EEA1Q15075 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
EEA1Q15075 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
EEA1Q15075 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
EEA1Q15075 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.59
EEA1Q15075 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.59
EEA1Q15075 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
EEA1Q15075 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.59
EEA1Q15075 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.59
EEA1Q15075 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC37.51■■■■□ 3.59
EEA1Q15075 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC37.51■■■■□ 3.59
EEA1Q15075 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.59
EEA1Q15075 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC37.51■■■■□ 3.59
EEA1Q15075 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC37.51■■■■□ 3.59
EEA1Q15075 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC37.51■■■■□ 3.59
EEA1Q15075 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
EEA1Q15075 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
EEA1Q15075 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
EEA1Q15075 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
EEA1Q15075 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC37.49■■■■□ 3.59
EEA1Q15075 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
EEA1Q15075 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
EEA1Q15075 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
EEA1Q15075 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
EEA1Q15075 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
EEA1Q15075 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
EEA1Q15075 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
EEA1Q15075 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
EEA1Q15075 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
EEA1Q15075 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
EEA1Q15075 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
EEA1Q15075 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
EEA1Q15075 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
EEA1Q15075 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
EEA1Q15075 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
EEA1Q15075 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
EEA1Q15075 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
EEA1Q15075 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
EEA1Q15075 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
EEA1Q15075 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
EEA1Q15075 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
EEA1Q15075 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
EEA1Q15075 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms