Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH18Q13634 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH18Q13634 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH18Q13634 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH18Q13634 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH18Q13634 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH18Q13634 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH18Q13634 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH18Q13634 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH18Q13634 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH18Q13634 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH18Q13634 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH18Q13634 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH18Q13634 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH18Q13634 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH18Q13634 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH18Q13634 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH18Q13634 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH18Q13634 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH18Q13634 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH18Q13634 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH18Q13634 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH18Q13634 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH18Q13634 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH18Q13634 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH18Q13634 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH18Q13634 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH18Q13634 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH18Q13634 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH18Q13634 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH18Q13634 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH18Q13634 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH18Q13634 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH18Q13634 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH18Q13634 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH18Q13634 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH18Q13634 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH18Q13634 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH18Q13634 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH18Q13634 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH18Q13634 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH18Q13634 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH18Q13634 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH18Q13634 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH18Q13634 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH18Q13634 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH18Q13634 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH18Q13634 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH18Q13634 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH18Q13634 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH18Q13634 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH18Q13634 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH18Q13634 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH18Q13634 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH18Q13634 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDH18Q13634 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH18Q13634 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH18Q13634 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH18Q13634 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH18Q13634 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH18Q13634 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH18Q13634 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH18Q13634 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH18Q13634 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH18Q13634 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH18Q13634 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH18Q13634 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH18Q13634 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH18Q13634 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH18Q13634 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH18Q13634 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH18Q13634 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH18Q13634 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH18Q13634 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH18Q13634 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH18Q13634 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH18Q13634 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH18Q13634 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH18Q13634 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH18Q13634 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH18Q13634 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH18Q13634 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH18Q13634 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH18Q13634 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH18Q13634 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH18Q13634 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH18Q13634 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH18Q13634 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH18Q13634 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH18Q13634 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH18Q13634 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH18Q13634 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH18Q13634 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH18Q13634 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH18Q13634 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH18Q13634 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH18Q13634 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH18Q13634 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH18Q13634 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH18Q13634 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
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