Protein–RNA interactions for Protein: Q13546

RIPK1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK1Q13546 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RIPK1Q13546 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIPK1Q13546 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIPK1Q13546 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIPK1Q13546 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIPK1Q13546 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIPK1Q13546 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIPK1Q13546 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIPK1Q13546 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIPK1Q13546 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIPK1Q13546 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIPK1Q13546 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIPK1Q13546 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIPK1Q13546 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIPK1Q13546 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIPK1Q13546 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIPK1Q13546 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIPK1Q13546 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIPK1Q13546 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIPK1Q13546 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIPK1Q13546 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIPK1Q13546 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RIPK1Q13546 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RIPK1Q13546 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RIPK1Q13546 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RIPK1Q13546 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RIPK1Q13546 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RIPK1Q13546 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RIPK1Q13546 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIPK1Q13546 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIPK1Q13546 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIPK1Q13546 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIPK1Q13546 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIPK1Q13546 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RIPK1Q13546 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIPK1Q13546 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIPK1Q13546 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RIPK1Q13546 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RIPK1Q13546 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RIPK1Q13546 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RIPK1Q13546 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RIPK1Q13546 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RIPK1Q13546 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RIPK1Q13546 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RIPK1Q13546 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIPK1Q13546 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIPK1Q13546 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIPK1Q13546 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIPK1Q13546 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIPK1Q13546 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RIPK1Q13546 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIPK1Q13546 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIPK1Q13546 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIPK1Q13546 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIPK1Q13546 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIPK1Q13546 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RIPK1Q13546 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIPK1Q13546 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RIPK1Q13546 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RIPK1Q13546 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RIPK1Q13546 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RIPK1Q13546 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RIPK1Q13546 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RIPK1Q13546 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RIPK1Q13546 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RIPK1Q13546 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RIPK1Q13546 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RIPK1Q13546 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RIPK1Q13546 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RIPK1Q13546 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RIPK1Q13546 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RIPK1Q13546 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RIPK1Q13546 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RIPK1Q13546 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RIPK1Q13546 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RIPK1Q13546 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RIPK1Q13546 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RIPK1Q13546 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RIPK1Q13546 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RIPK1Q13546 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RIPK1Q13546 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RIPK1Q13546 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RIPK1Q13546 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RIPK1Q13546 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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