Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMED1Q13445 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMED1Q13445 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMED1Q13445 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMED1Q13445 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMED1Q13445 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMED1Q13445 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMED1Q13445 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMED1Q13445 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TMED1Q13445 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMED1Q13445 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMED1Q13445 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMED1Q13445 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMED1Q13445 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMED1Q13445 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMED1Q13445 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMED1Q13445 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMED1Q13445 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMED1Q13445 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMED1Q13445 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMED1Q13445 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMED1Q13445 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMED1Q13445 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMED1Q13445 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMED1Q13445 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMED1Q13445 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMED1Q13445 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMED1Q13445 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMED1Q13445 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMED1Q13445 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMED1Q13445 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMED1Q13445 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMED1Q13445 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMED1Q13445 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMED1Q13445 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMED1Q13445 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMED1Q13445 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMED1Q13445 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMED1Q13445 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMED1Q13445 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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TMED1Q13445 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMED1Q13445 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMED1Q13445 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMED1Q13445 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMED1Q13445 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMED1Q13445 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMED1Q13445 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMED1Q13445 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMED1Q13445 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMED1Q13445 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMED1Q13445 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMED1Q13445 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMED1Q13445 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMED1Q13445 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TMED1Q13445 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMED1Q13445 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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TMED1Q13445 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMED1Q13445 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMED1Q13445 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMED1Q13445 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMED1Q13445 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMED1Q13445 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMED1Q13445 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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TMED1Q13445 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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TMED1Q13445 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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TMED1Q13445 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMED1Q13445 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMED1Q13445 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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TMED1Q13445 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TMED1Q13445 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMED1Q13445 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMED1Q13445 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMED1Q13445 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMED1Q13445 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMED1Q13445 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMED1Q13445 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMED1Q13445 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMED1Q13445 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMED1Q13445 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMED1Q13445 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMED1Q13445 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMED1Q13445 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
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