Protein–RNA interactions for Protein: Q07869

PPARA, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARAQ07869 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PPARAQ07869 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PPARAQ07869 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPARAQ07869 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPARAQ07869 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPARAQ07869 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPARAQ07869 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPARAQ07869 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPARAQ07869 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPARAQ07869 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPARAQ07869 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPARAQ07869 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPARAQ07869 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPARAQ07869 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PPARAQ07869 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPARAQ07869 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPARAQ07869 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPARAQ07869 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPARAQ07869 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPARAQ07869 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPARAQ07869 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPARAQ07869 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPARAQ07869 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPARAQ07869 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPARAQ07869 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPARAQ07869 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PPARAQ07869 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PPARAQ07869 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPARAQ07869 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PPARAQ07869 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PPARAQ07869 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PPARAQ07869 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PPARAQ07869 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PPARAQ07869 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PPARAQ07869 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PPARAQ07869 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPARAQ07869 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPARAQ07869 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPARAQ07869 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPARAQ07869 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPARAQ07869 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPARAQ07869 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPARAQ07869 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPARAQ07869 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPARAQ07869 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
PPARAQ07869 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PPARAQ07869 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PPARAQ07869 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPARAQ07869 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPARAQ07869 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPARAQ07869 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPARAQ07869 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPARAQ07869 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PPARAQ07869 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PPARAQ07869 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PPARAQ07869 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PPARAQ07869 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PPARAQ07869 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PPARAQ07869 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PPARAQ07869 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PPARAQ07869 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PPARAQ07869 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PPARAQ07869 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PPARAQ07869 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPARAQ07869 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPARAQ07869 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPARAQ07869 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPARAQ07869 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPARAQ07869 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPARAQ07869 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPARAQ07869 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPARAQ07869 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPARAQ07869 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPARAQ07869 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPARAQ07869 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPARAQ07869 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPARAQ07869 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPARAQ07869 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPARAQ07869 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPARAQ07869 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPARAQ07869 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPARAQ07869 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPARAQ07869 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PPARAQ07869 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPARAQ07869 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPARAQ07869 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPARAQ07869 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPARAQ07869 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPARAQ07869 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPARAQ07869 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPARAQ07869 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPARAQ07869 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPARAQ07869 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPARAQ07869 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPARAQ07869 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PPARAQ07869 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PPARAQ07869 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PPARAQ07869 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PPARAQ07869 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPARAQ07869 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms