Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
OTUD4Q01804 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
OTUD4Q01804 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
OTUD4Q01804 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
OTUD4Q01804 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
OTUD4Q01804 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
OTUD4Q01804 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
OTUD4Q01804 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
OTUD4Q01804 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
OTUD4Q01804 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
OTUD4Q01804 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
OTUD4Q01804 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
OTUD4Q01804 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
OTUD4Q01804 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
OTUD4Q01804 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
OTUD4Q01804 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
OTUD4Q01804 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTUD4Q01804 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTUD4Q01804 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTUD4Q01804 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTUD4Q01804 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTUD4Q01804 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTUD4Q01804 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTUD4Q01804 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTUD4Q01804 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
OTUD4Q01804 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTUD4Q01804 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTUD4Q01804 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTUD4Q01804 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTUD4Q01804 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTUD4Q01804 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTUD4Q01804 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTUD4Q01804 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTUD4Q01804 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTUD4Q01804 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTUD4Q01804 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTUD4Q01804 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTUD4Q01804 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTUD4Q01804 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTUD4Q01804 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTUD4Q01804 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTUD4Q01804 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTUD4Q01804 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTUD4Q01804 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTUD4Q01804 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTUD4Q01804 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTUD4Q01804 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTUD4Q01804 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTUD4Q01804 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTUD4Q01804 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTUD4Q01804 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTUD4Q01804 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTUD4Q01804 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTUD4Q01804 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTUD4Q01804 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTUD4Q01804 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTUD4Q01804 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTUD4Q01804 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
OTUD4Q01804 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTUD4Q01804 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTUD4Q01804 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
OTUD4Q01804 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTUD4Q01804 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTUD4Q01804 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTUD4Q01804 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTUD4Q01804 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTUD4Q01804 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTUD4Q01804 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTUD4Q01804 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTUD4Q01804 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTUD4Q01804 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTUD4Q01804 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTUD4Q01804 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTUD4Q01804 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTUD4Q01804 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTUD4Q01804 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTUD4Q01804 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTUD4Q01804 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTUD4Q01804 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTUD4Q01804 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTUD4Q01804 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTUD4Q01804 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTUD4Q01804 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTUD4Q01804 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTUD4Q01804 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTUD4Q01804 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTUD4Q01804 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTUD4Q01804 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTUD4Q01804 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTUD4Q01804 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
OTUD4Q01804 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
OTUD4Q01804 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
OTUD4Q01804 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
OTUD4Q01804 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
OTUD4Q01804 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
OTUD4Q01804 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
OTUD4Q01804 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
OTUD4Q01804 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
OTUD4Q01804 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
OTUD4Q01804 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms