Protein–RNA interactions for Protein: Q01196

RUNX1, Runt-related transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1Q01196 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RUNX1Q01196 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RUNX1Q01196 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RUNX1Q01196 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RUNX1Q01196 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RUNX1Q01196 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUNX1Q01196 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUNX1Q01196 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUNX1Q01196 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUNX1Q01196 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUNX1Q01196 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUNX1Q01196 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUNX1Q01196 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUNX1Q01196 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RUNX1Q01196 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUNX1Q01196 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUNX1Q01196 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RUNX1Q01196 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RUNX1Q01196 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RUNX1Q01196 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RUNX1Q01196 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RUNX1Q01196 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RUNX1Q01196 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RUNX1Q01196 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RUNX1Q01196 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RUNX1Q01196 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RUNX1Q01196 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RUNX1Q01196 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RUNX1Q01196 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RUNX1Q01196 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RUNX1Q01196 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RUNX1Q01196 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RUNX1Q01196 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RUNX1Q01196 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RUNX1Q01196 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RUNX1Q01196 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RUNX1Q01196 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RUNX1Q01196 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RUNX1Q01196 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RUNX1Q01196 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RUNX1Q01196 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RUNX1Q01196 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RUNX1Q01196 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RUNX1Q01196 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RUNX1Q01196 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUNX1Q01196 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUNX1Q01196 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUNX1Q01196 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUNX1Q01196 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUNX1Q01196 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUNX1Q01196 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUNX1Q01196 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUNX1Q01196 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUNX1Q01196 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUNX1Q01196 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUNX1Q01196 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUNX1Q01196 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RUNX1Q01196 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUNX1Q01196 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUNX1Q01196 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUNX1Q01196 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUNX1Q01196 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUNX1Q01196 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUNX1Q01196 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUNX1Q01196 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUNX1Q01196 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms