Protein–RNA interactions for Protein: P62851

RPS25, 40S ribosomal protein S25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS25P62851 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS25P62851 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS25P62851 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS25P62851 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS25P62851 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS25P62851 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS25P62851 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS25P62851 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS25P62851 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS25P62851 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS25P62851 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS25P62851 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS25P62851 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS25P62851 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS25P62851 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS25P62851 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS25P62851 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS25P62851 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPS25P62851 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPS25P62851 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPS25P62851 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPS25P62851 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPS25P62851 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPS25P62851 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPS25P62851 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPS25P62851 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPS25P62851 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPS25P62851 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPS25P62851 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPS25P62851 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPS25P62851 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPS25P62851 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPS25P62851 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPS25P62851 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPS25P62851 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPS25P62851 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPS25P62851 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPS25P62851 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPS25P62851 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPS25P62851 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPS25P62851 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPS25P62851 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPS25P62851 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPS25P62851 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RPS25P62851 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPS25P62851 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPS25P62851 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPS25P62851 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPS25P62851 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RPS25P62851 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPS25P62851 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS25P62851 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS25P62851 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS25P62851 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS25P62851 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS25P62851 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS25P62851 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS25P62851 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS25P62851 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS25P62851 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS25P62851 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS25P62851 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS25P62851 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS25P62851 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS25P62851 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS25P62851 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS25P62851 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS25P62851 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS25P62851 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS25P62851 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS25P62851 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS25P62851 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS25P62851 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS25P62851 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS25P62851 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS25P62851 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS25P62851 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS25P62851 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS25P62851 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS25P62851 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS25P62851 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS25P62851 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS25P62851 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS25P62851 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS25P62851 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS25P62851 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS25P62851 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS25P62851 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS25P62851 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS25P62851 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS25P62851 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS25P62851 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS25P62851 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS25P62851 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS25P62851 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS25P62851 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS25P62851 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS25P62851 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS25P62851 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS25P62851 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms