Protein–RNA interactions for Protein: P62136

PPP1CA, Serine/threonine-protein phosphatase PP1-alpha catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CAP62136 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP1CAP62136 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP1CAP62136 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PPP1CAP62136 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PPP1CAP62136 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP1CAP62136 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP1CAP62136 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP1CAP62136 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP1CAP62136 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP1CAP62136 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP1CAP62136 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP1CAP62136 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP1CAP62136 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP1CAP62136 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP1CAP62136 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP1CAP62136 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP1CAP62136 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP1CAP62136 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP1CAP62136 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP1CAP62136 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP1CAP62136 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP1CAP62136 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP1CAP62136 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP1CAP62136 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP1CAP62136 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP1CAP62136 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP1CAP62136 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP1CAP62136 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP1CAP62136 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPP1CAP62136 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPP1CAP62136 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPP1CAP62136 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPP1CAP62136 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPP1CAP62136 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPP1CAP62136 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PPP1CAP62136 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPP1CAP62136 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPP1CAP62136 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PPP1CAP62136 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPP1CAP62136 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPP1CAP62136 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPP1CAP62136 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPP1CAP62136 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPP1CAP62136 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPP1CAP62136 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPP1CAP62136 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPP1CAP62136 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPP1CAP62136 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPP1CAP62136 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPP1CAP62136 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPP1CAP62136 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPP1CAP62136 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPP1CAP62136 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPP1CAP62136 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPP1CAP62136 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPP1CAP62136 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPP1CAP62136 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPP1CAP62136 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PPP1CAP62136 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPP1CAP62136 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPP1CAP62136 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPP1CAP62136 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPP1CAP62136 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPP1CAP62136 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPP1CAP62136 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPP1CAP62136 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPP1CAP62136 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPP1CAP62136 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPP1CAP62136 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPP1CAP62136 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPP1CAP62136 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPP1CAP62136 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPP1CAP62136 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PPP1CAP62136 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PPP1CAP62136 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPP1CAP62136 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPP1CAP62136 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPP1CAP62136 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPP1CAP62136 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPP1CAP62136 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPP1CAP62136 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPP1CAP62136 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPP1CAP62136 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPP1CAP62136 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPP1CAP62136 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPP1CAP62136 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPP1CAP62136 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPP1CAP62136 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPP1CAP62136 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PPP1CAP62136 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPP1CAP62136 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPP1CAP62136 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPP1CAP62136 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPP1CAP62136 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPP1CAP62136 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPP1CAP62136 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPP1CAP62136 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPP1CAP62136 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPP1CAP62136 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPP1CAP62136 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms