Protein–RNA interactions for Protein: P31645

SLC6A4, Sodium-dependent serotonin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A4P31645 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC6A4P31645 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC6A4P31645 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC6A4P31645 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC6A4P31645 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC6A4P31645 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC6A4P31645 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC6A4P31645 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC6A4P31645 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC6A4P31645 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC6A4P31645 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC6A4P31645 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC6A4P31645 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC6A4P31645 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC6A4P31645 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC6A4P31645 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC6A4P31645 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC6A4P31645 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC6A4P31645 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC6A4P31645 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC6A4P31645 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC6A4P31645 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC6A4P31645 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC6A4P31645 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC6A4P31645 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC6A4P31645 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC6A4P31645 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC6A4P31645 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC6A4P31645 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC6A4P31645 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC6A4P31645 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC6A4P31645 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC6A4P31645 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC6A4P31645 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC6A4P31645 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC6A4P31645 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC6A4P31645 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC6A4P31645 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC6A4P31645 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC6A4P31645 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC6A4P31645 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC6A4P31645 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC6A4P31645 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC6A4P31645 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC6A4P31645 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC6A4P31645 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC6A4P31645 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC6A4P31645 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC6A4P31645 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC6A4P31645 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC6A4P31645 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC6A4P31645 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC6A4P31645 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC6A4P31645 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC6A4P31645 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC6A4P31645 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC6A4P31645 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC6A4P31645 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC6A4P31645 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC6A4P31645 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC6A4P31645 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC6A4P31645 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC6A4P31645 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC6A4P31645 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC6A4P31645 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC6A4P31645 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC6A4P31645 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC6A4P31645 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC6A4P31645 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC6A4P31645 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC6A4P31645 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC6A4P31645 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC6A4P31645 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC6A4P31645 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC6A4P31645 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC6A4P31645 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC6A4P31645 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC6A4P31645 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC6A4P31645 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC6A4P31645 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC6A4P31645 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC6A4P31645 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC6A4P31645 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC6A4P31645 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC6A4P31645 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC6A4P31645 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC6A4P31645 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC6A4P31645 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC6A4P31645 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC6A4P31645 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC6A4P31645 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC6A4P31645 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC6A4P31645 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC6A4P31645 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC6A4P31645 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC6A4P31645 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC6A4P31645 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC6A4P31645 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC6A4P31645 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC6A4P31645 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms