Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GTF2E1P29083 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GTF2E1P29083 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GTF2E1P29083 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GTF2E1P29083 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GTF2E1P29083 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GTF2E1P29083 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GTF2E1P29083 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GTF2E1P29083 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GTF2E1P29083 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GTF2E1P29083 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GTF2E1P29083 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
GTF2E1P29083 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GTF2E1P29083 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GTF2E1P29083 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GTF2E1P29083 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GTF2E1P29083 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GTF2E1P29083 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GTF2E1P29083 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GTF2E1P29083 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
GTF2E1P29083 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GTF2E1P29083 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GTF2E1P29083 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GTF2E1P29083 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GTF2E1P29083 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GTF2E1P29083 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GTF2E1P29083 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GTF2E1P29083 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GTF2E1P29083 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GTF2E1P29083 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
GTF2E1P29083 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GTF2E1P29083 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GTF2E1P29083 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GTF2E1P29083 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
GTF2E1P29083 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GTF2E1P29083 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
GTF2E1P29083 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GTF2E1P29083 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GTF2E1P29083 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GTF2E1P29083 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GTF2E1P29083 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GTF2E1P29083 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GTF2E1P29083 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GTF2E1P29083 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GTF2E1P29083 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GTF2E1P29083 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GTF2E1P29083 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GTF2E1P29083 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GTF2E1P29083 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GTF2E1P29083 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GTF2E1P29083 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GTF2E1P29083 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GTF2E1P29083 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GTF2E1P29083 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GTF2E1P29083 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GTF2E1P29083 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GTF2E1P29083 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GTF2E1P29083 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GTF2E1P29083 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GTF2E1P29083 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GTF2E1P29083 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GTF2E1P29083 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GTF2E1P29083 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GTF2E1P29083 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GTF2E1P29083 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GTF2E1P29083 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GTF2E1P29083 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GTF2E1P29083 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GTF2E1P29083 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GTF2E1P29083 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
GTF2E1P29083 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GTF2E1P29083 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
GTF2E1P29083 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GTF2E1P29083 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GTF2E1P29083 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GTF2E1P29083 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GTF2E1P29083 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GTF2E1P29083 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GTF2E1P29083 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GTF2E1P29083 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GTF2E1P29083 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GTF2E1P29083 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GTF2E1P29083 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
GTF2E1P29083 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GTF2E1P29083 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GTF2E1P29083 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GTF2E1P29083 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GTF2E1P29083 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GTF2E1P29083 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GTF2E1P29083 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GTF2E1P29083 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GTF2E1P29083 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GTF2E1P29083 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GTF2E1P29083 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GTF2E1P29083 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
GTF2E1P29083 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GTF2E1P29083 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GTF2E1P29083 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GTF2E1P29083 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GTF2E1P29083 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms