Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLNP26678 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PLNP26678 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLNP26678 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLNP26678 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLNP26678 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLNP26678 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLNP26678 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLNP26678 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLNP26678 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLNP26678 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLNP26678 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLNP26678 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLNP26678 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLNP26678 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLNP26678 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLNP26678 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLNP26678 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLNP26678 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLNP26678 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLNP26678 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLNP26678 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLNP26678 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLNP26678 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLNP26678 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLNP26678 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLNP26678 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLNP26678 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLNP26678 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLNP26678 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLNP26678 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLNP26678 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLNP26678 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLNP26678 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLNP26678 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLNP26678 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLNP26678 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLNP26678 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLNP26678 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLNP26678 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLNP26678 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLNP26678 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLNP26678 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLNP26678 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLNP26678 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLNP26678 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLNP26678 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLNP26678 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLNP26678 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLNP26678 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLNP26678 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLNP26678 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLNP26678 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLNP26678 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLNP26678 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLNP26678 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLNP26678 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLNP26678 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLNP26678 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLNP26678 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLNP26678 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLNP26678 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLNP26678 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLNP26678 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLNP26678 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLNP26678 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLNP26678 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PLNP26678 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PLNP26678 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PLNP26678 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PLNP26678 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PLNP26678 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PLNP26678 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PLNP26678 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PLNP26678 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLNP26678 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLNP26678 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLNP26678 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLNP26678 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLNP26678 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLNP26678 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLNP26678 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLNP26678 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLNP26678 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLNP26678 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PLNP26678 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PLNP26678 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PLNP26678 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PLNP26678 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PLNP26678 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PLNP26678 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PLNP26678 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PLNP26678 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PLNP26678 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PLNP26678 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PLNP26678 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLNP26678 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLNP26678 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLNP26678 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLNP26678 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms