Protein–RNA interactions for Protein: P19623

SRM, Spermidine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRMP19623 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SRMP19623 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SRMP19623 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SRMP19623 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SRMP19623 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SRMP19623 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SRMP19623 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SRMP19623 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SRMP19623 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SRMP19623 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SRMP19623 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SRMP19623 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SRMP19623 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SRMP19623 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SRMP19623 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SRMP19623 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SRMP19623 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SRMP19623 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SRMP19623 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SRMP19623 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SRMP19623 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SRMP19623 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SRMP19623 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRMP19623 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRMP19623 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRMP19623 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRMP19623 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRMP19623 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRMP19623 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRMP19623 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRMP19623 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRMP19623 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRMP19623 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRMP19623 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRMP19623 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRMP19623 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRMP19623 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRMP19623 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRMP19623 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRMP19623 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRMP19623 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRMP19623 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SRMP19623 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRMP19623 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRMP19623 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRMP19623 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRMP19623 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRMP19623 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRMP19623 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRMP19623 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SRMP19623 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SRMP19623 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SRMP19623 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SRMP19623 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SRMP19623 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SRMP19623 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SRMP19623 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SRMP19623 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SRMP19623 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SRMP19623 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SRMP19623 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SRMP19623 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SRMP19623 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SRMP19623 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRMP19623 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRMP19623 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRMP19623 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRMP19623 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRMP19623 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRMP19623 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRMP19623 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRMP19623 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRMP19623 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRMP19623 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SRMP19623 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SRMP19623 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SRMP19623 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SRMP19623 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SRMP19623 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SRMP19623 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SRMP19623 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SRMP19623 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SRMP19623 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SRMP19623 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SRMP19623 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SRMP19623 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SRMP19623 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SRMP19623 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SRMP19623 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SRMP19623 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SRMP19623 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SRMP19623 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SRMP19623 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SRMP19623 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SRMP19623 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SRMP19623 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SRMP19623 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SRMP19623 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SRMP19623 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SRMP19623 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms