Protein–RNA interactions for Protein: P18669

PGAM1, Phosphoglycerate mutase 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM1P18669 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGAM1P18669 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGAM1P18669 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGAM1P18669 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGAM1P18669 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGAM1P18669 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGAM1P18669 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGAM1P18669 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGAM1P18669 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGAM1P18669 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGAM1P18669 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGAM1P18669 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGAM1P18669 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGAM1P18669 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGAM1P18669 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGAM1P18669 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGAM1P18669 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PGAM1P18669 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGAM1P18669 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGAM1P18669 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGAM1P18669 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGAM1P18669 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGAM1P18669 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PGAM1P18669 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGAM1P18669 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGAM1P18669 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGAM1P18669 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGAM1P18669 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGAM1P18669 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGAM1P18669 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGAM1P18669 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGAM1P18669 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGAM1P18669 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGAM1P18669 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGAM1P18669 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGAM1P18669 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGAM1P18669 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGAM1P18669 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGAM1P18669 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGAM1P18669 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGAM1P18669 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGAM1P18669 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PGAM1P18669 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PGAM1P18669 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGAM1P18669 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGAM1P18669 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PGAM1P18669 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGAM1P18669 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGAM1P18669 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGAM1P18669 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGAM1P18669 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGAM1P18669 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGAM1P18669 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGAM1P18669 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGAM1P18669 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGAM1P18669 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGAM1P18669 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PGAM1P18669 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGAM1P18669 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGAM1P18669 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGAM1P18669 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGAM1P18669 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGAM1P18669 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGAM1P18669 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PGAM1P18669 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGAM1P18669 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PGAM1P18669 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGAM1P18669 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGAM1P18669 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGAM1P18669 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGAM1P18669 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGAM1P18669 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PGAM1P18669 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PGAM1P18669 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PGAM1P18669 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PGAM1P18669 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PGAM1P18669 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PGAM1P18669 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PGAM1P18669 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PGAM1P18669 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PGAM1P18669 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PGAM1P18669 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PGAM1P18669 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PGAM1P18669 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PGAM1P18669 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PGAM1P18669 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PGAM1P18669 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PGAM1P18669 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGAM1P18669 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGAM1P18669 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGAM1P18669 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGAM1P18669 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGAM1P18669 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGAM1P18669 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGAM1P18669 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGAM1P18669 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGAM1P18669 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGAM1P18669 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGAM1P18669 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGAM1P18669 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms