Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC166P0CW27 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC166P0CW27 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC166P0CW27 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC166P0CW27 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC166P0CW27 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC166P0CW27 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC166P0CW27 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC166P0CW27 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC166P0CW27 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC166P0CW27 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC166P0CW27 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC166P0CW27 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC166P0CW27 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC166P0CW27 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC166P0CW27 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC166P0CW27 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC166P0CW27 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC166P0CW27 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC166P0CW27 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC166P0CW27 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC166P0CW27 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC166P0CW27 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC166P0CW27 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC166P0CW27 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC166P0CW27 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC166P0CW27 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC166P0CW27 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC166P0CW27 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC166P0CW27 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC166P0CW27 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC166P0CW27 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC166P0CW27 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC166P0CW27 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC166P0CW27 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC166P0CW27 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC166P0CW27 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC166P0CW27 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC166P0CW27 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC166P0CW27 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC166P0CW27 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC166P0CW27 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC166P0CW27 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC166P0CW27 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC166P0CW27 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC166P0CW27 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC166P0CW27 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC166P0CW27 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC166P0CW27 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC166P0CW27 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC166P0CW27 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC166P0CW27 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC166P0CW27 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC166P0CW27 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC166P0CW27 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC166P0CW27 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC166P0CW27 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC166P0CW27 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC166P0CW27 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC166P0CW27 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC166P0CW27 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC166P0CW27 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC166P0CW27 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC166P0CW27 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC166P0CW27 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC166P0CW27 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC166P0CW27 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC166P0CW27 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC166P0CW27 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC166P0CW27 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC166P0CW27 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC166P0CW27 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC166P0CW27 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC166P0CW27 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC166P0CW27 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC166P0CW27 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC166P0CW27 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC166P0CW27 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC166P0CW27 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC166P0CW27 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC166P0CW27 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC166P0CW27 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC166P0CW27 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC166P0CW27 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC166P0CW27 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC166P0CW27 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC166P0CW27 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC166P0CW27 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC166P0CW27 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC166P0CW27 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC166P0CW27 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC166P0CW27 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC166P0CW27 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC166P0CW27 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC166P0CW27 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC166P0CW27 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC166P0CW27 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC166P0CW27 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC166P0CW27 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC166P0CW27 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.7 ms