Protein–RNA interactions for Protein: P0C866

LINC00869, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00869, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00869P0C866 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00869P0C866 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00869P0C866 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00869P0C866 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00869P0C866 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00869P0C866 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00869P0C866 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00869P0C866 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00869P0C866 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00869P0C866 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00869P0C866 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00869P0C866 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00869P0C866 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00869P0C866 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00869P0C866 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00869P0C866 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00869P0C866 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00869P0C866 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00869P0C866 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00869P0C866 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
LINC00869P0C866 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00869P0C866 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms