Protein–RNA interactions for Protein: P04156

PRNP, Major prion protein, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRNPP04156 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRNPP04156 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PRNPP04156 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRNPP04156 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRNPP04156 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRNPP04156 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRNPP04156 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRNPP04156 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRNPP04156 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PRNPP04156 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PRNPP04156 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRNPP04156 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRNPP04156 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRNPP04156 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRNPP04156 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRNPP04156 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRNPP04156 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRNPP04156 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRNPP04156 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRNPP04156 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRNPP04156 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRNPP04156 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRNPP04156 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRNPP04156 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRNPP04156 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRNPP04156 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRNPP04156 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRNPP04156 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRNPP04156 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PRNPP04156 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRNPP04156 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRNPP04156 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRNPP04156 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRNPP04156 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PRNPP04156 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRNPP04156 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRNPP04156 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRNPP04156 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PRNPP04156 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRNPP04156 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRNPP04156 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRNPP04156 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRNPP04156 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRNPP04156 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRNPP04156 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRNPP04156 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRNPP04156 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRNPP04156 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRNPP04156 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRNPP04156 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PRNPP04156 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRNPP04156 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRNPP04156 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRNPP04156 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRNPP04156 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRNPP04156 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRNPP04156 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRNPP04156 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRNPP04156 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRNPP04156 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRNPP04156 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRNPP04156 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRNPP04156 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRNPP04156 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRNPP04156 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRNPP04156 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRNPP04156 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRNPP04156 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRNPP04156 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRNPP04156 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRNPP04156 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PRNPP04156 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRNPP04156 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PRNPP04156 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRNPP04156 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRNPP04156 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PRNPP04156 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRNPP04156 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRNPP04156 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRNPP04156 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PRNPP04156 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRNPP04156 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRNPP04156 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRNPP04156 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRNPP04156 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRNPP04156 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRNPP04156 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRNPP04156 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRNPP04156 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRNPP04156 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRNPP04156 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRNPP04156 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PRNPP04156 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PRNPP04156 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRNPP04156 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRNPP04156 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRNPP04156 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRNPP04156 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRNPP04156 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRNPP04156 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms