Protein–RNA interactions for Protein: O75386

TULP3, Tubby-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP3O75386 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TULP3O75386 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TULP3O75386 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TULP3O75386 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TULP3O75386 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TULP3O75386 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TULP3O75386 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TULP3O75386 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TULP3O75386 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TULP3O75386 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TULP3O75386 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TULP3O75386 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TULP3O75386 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TULP3O75386 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TULP3O75386 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TULP3O75386 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TULP3O75386 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TULP3O75386 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TULP3O75386 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TULP3O75386 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TULP3O75386 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TULP3O75386 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TULP3O75386 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TULP3O75386 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TULP3O75386 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TULP3O75386 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TULP3O75386 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TULP3O75386 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TULP3O75386 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TULP3O75386 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TULP3O75386 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TULP3O75386 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TULP3O75386 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TULP3O75386 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TULP3O75386 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TULP3O75386 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TULP3O75386 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TULP3O75386 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TULP3O75386 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TULP3O75386 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TULP3O75386 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TULP3O75386 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TULP3O75386 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TULP3O75386 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TULP3O75386 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TULP3O75386 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TULP3O75386 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TULP3O75386 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TULP3O75386 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TULP3O75386 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TULP3O75386 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TULP3O75386 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TULP3O75386 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TULP3O75386 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TULP3O75386 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TULP3O75386 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TULP3O75386 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TULP3O75386 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TULP3O75386 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TULP3O75386 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TULP3O75386 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TULP3O75386 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TULP3O75386 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TULP3O75386 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TULP3O75386 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TULP3O75386 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TULP3O75386 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TULP3O75386 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TULP3O75386 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TULP3O75386 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TULP3O75386 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TULP3O75386 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TULP3O75386 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TULP3O75386 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TULP3O75386 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TULP3O75386 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TULP3O75386 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TULP3O75386 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TULP3O75386 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TULP3O75386 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TULP3O75386 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TULP3O75386 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TULP3O75386 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TULP3O75386 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TULP3O75386 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TULP3O75386 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TULP3O75386 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TULP3O75386 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TULP3O75386 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TULP3O75386 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TULP3O75386 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TULP3O75386 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TULP3O75386 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TULP3O75386 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TULP3O75386 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TULP3O75386 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TULP3O75386 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TULP3O75386 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TULP3O75386 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TULP3O75386 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms