Protein–RNA interactions for Protein: O60231

DHX16, Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX16O60231 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DHX16O60231 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DHX16O60231 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DHX16O60231 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DHX16O60231 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DHX16O60231 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DHX16O60231 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DHX16O60231 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DHX16O60231 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DHX16O60231 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DHX16O60231 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DHX16O60231 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DHX16O60231 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DHX16O60231 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DHX16O60231 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DHX16O60231 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DHX16O60231 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DHX16O60231 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DHX16O60231 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DHX16O60231 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DHX16O60231 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DHX16O60231 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DHX16O60231 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DHX16O60231 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DHX16O60231 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DHX16O60231 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DHX16O60231 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DHX16O60231 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DHX16O60231 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DHX16O60231 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DHX16O60231 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DHX16O60231 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
DHX16O60231 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DHX16O60231 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
DHX16O60231 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
DHX16O60231 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DHX16O60231 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DHX16O60231 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DHX16O60231 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DHX16O60231 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
DHX16O60231 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DHX16O60231 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DHX16O60231 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DHX16O60231 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DHX16O60231 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DHX16O60231 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DHX16O60231 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DHX16O60231 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DHX16O60231 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DHX16O60231 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DHX16O60231 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DHX16O60231 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
DHX16O60231 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DHX16O60231 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DHX16O60231 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DHX16O60231 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DHX16O60231 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DHX16O60231 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DHX16O60231 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DHX16O60231 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DHX16O60231 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DHX16O60231 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DHX16O60231 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DHX16O60231 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DHX16O60231 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DHX16O60231 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DHX16O60231 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DHX16O60231 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DHX16O60231 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DHX16O60231 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DHX16O60231 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DHX16O60231 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DHX16O60231 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DHX16O60231 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DHX16O60231 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DHX16O60231 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DHX16O60231 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DHX16O60231 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
DHX16O60231 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
DHX16O60231 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DHX16O60231 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DHX16O60231 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DHX16O60231 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DHX16O60231 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DHX16O60231 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DHX16O60231 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DHX16O60231 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DHX16O60231 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DHX16O60231 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
DHX16O60231 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
DHX16O60231 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
DHX16O60231 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
DHX16O60231 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DHX16O60231 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DHX16O60231 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DHX16O60231 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DHX16O60231 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DHX16O60231 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DHX16O60231 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DHX16O60231 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.2 ms