Protein–RNA interactions for Protein: O43303

CCP110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCP110O43303 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCP110O43303 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCP110O43303 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCP110O43303 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCP110O43303 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCP110O43303 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCP110O43303 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCP110O43303 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCP110O43303 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCP110O43303 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCP110O43303 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCP110O43303 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCP110O43303 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCP110O43303 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCP110O43303 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCP110O43303 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCP110O43303 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCP110O43303 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCP110O43303 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCP110O43303 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCP110O43303 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCP110O43303 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCP110O43303 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCP110O43303 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCP110O43303 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCP110O43303 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCP110O43303 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCP110O43303 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCP110O43303 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCP110O43303 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCP110O43303 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCP110O43303 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCP110O43303 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCP110O43303 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCP110O43303 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCP110O43303 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCP110O43303 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCP110O43303 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCP110O43303 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCP110O43303 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCP110O43303 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCP110O43303 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCP110O43303 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCP110O43303 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCP110O43303 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCP110O43303 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCP110O43303 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCP110O43303 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCP110O43303 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCP110O43303 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCP110O43303 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCP110O43303 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCP110O43303 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCP110O43303 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCP110O43303 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCP110O43303 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CCP110O43303 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CCP110O43303 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCP110O43303 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCP110O43303 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCP110O43303 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCP110O43303 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCP110O43303 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCP110O43303 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCP110O43303 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCP110O43303 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCP110O43303 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCP110O43303 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCP110O43303 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCP110O43303 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCP110O43303 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCP110O43303 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCP110O43303 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCP110O43303 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCP110O43303 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCP110O43303 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCP110O43303 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCP110O43303 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCP110O43303 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCP110O43303 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCP110O43303 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCP110O43303 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCP110O43303 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCP110O43303 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCP110O43303 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCP110O43303 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCP110O43303 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCP110O43303 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCP110O43303 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCP110O43303 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCP110O43303 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCP110O43303 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCP110O43303 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCP110O43303 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCP110O43303 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCP110O43303 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCP110O43303 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCP110O43303 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCP110O43303 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCP110O43303 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms