Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRRTM2O43300 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRRTM2O43300 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRRTM2O43300 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRRTM2O43300 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRRTM2O43300 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
LRRTM2O43300 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRRTM2O43300 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRRTM2O43300 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRRTM2O43300 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRTM2O43300 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRTM2O43300 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRTM2O43300 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRTM2O43300 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRTM2O43300 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRTM2O43300 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRTM2O43300 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRTM2O43300 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRTM2O43300 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRTM2O43300 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRTM2O43300 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRTM2O43300 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRTM2O43300 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRTM2O43300 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRTM2O43300 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRTM2O43300 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRTM2O43300 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRTM2O43300 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LRRTM2O43300 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LRRTM2O43300 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LRRTM2O43300 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LRRTM2O43300 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LRRTM2O43300 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRRTM2O43300 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRRTM2O43300 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRRTM2O43300 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRRTM2O43300 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRRTM2O43300 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRRTM2O43300 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
LRRTM2O43300 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRRTM2O43300 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRTM2O43300 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRTM2O43300 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRTM2O43300 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRTM2O43300 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRTM2O43300 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRTM2O43300 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRTM2O43300 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRTM2O43300 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRTM2O43300 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRTM2O43300 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRTM2O43300 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRTM2O43300 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRTM2O43300 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRTM2O43300 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRTM2O43300 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRTM2O43300 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRTM2O43300 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRTM2O43300 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRTM2O43300 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRTM2O43300 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRTM2O43300 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRTM2O43300 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRTM2O43300 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRTM2O43300 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRTM2O43300 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRTM2O43300 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRTM2O43300 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRTM2O43300 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRTM2O43300 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRTM2O43300 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRTM2O43300 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRTM2O43300 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRTM2O43300 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRTM2O43300 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRTM2O43300 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRTM2O43300 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRTM2O43300 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRTM2O43300 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRTM2O43300 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRTM2O43300 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRTM2O43300 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRTM2O43300 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRTM2O43300 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRTM2O43300 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRTM2O43300 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRTM2O43300 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRTM2O43300 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRTM2O43300 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRTM2O43300 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRTM2O43300 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRTM2O43300 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRTM2O43300 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRTM2O43300 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRTM2O43300 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRRTM2O43300 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRRTM2O43300 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRRTM2O43300 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRRTM2O43300 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRRTM2O43300 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
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