Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF3BA8MYP8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF3BA8MYP8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF3BA8MYP8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF3BA8MYP8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF3BA8MYP8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF3BA8MYP8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF3BA8MYP8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF3BA8MYP8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF3BA8MYP8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF3BA8MYP8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF3BA8MYP8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF3BA8MYP8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF3BA8MYP8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF3BA8MYP8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF3BA8MYP8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF3BA8MYP8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF3BA8MYP8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF3BA8MYP8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF3BA8MYP8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF3BA8MYP8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF3BA8MYP8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF3BA8MYP8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF3BA8MYP8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODF3BA8MYP8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODF3BA8MYP8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODF3BA8MYP8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODF3BA8MYP8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODF3BA8MYP8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODF3BA8MYP8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODF3BA8MYP8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODF3BA8MYP8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODF3BA8MYP8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODF3BA8MYP8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODF3BA8MYP8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODF3BA8MYP8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODF3BA8MYP8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODF3BA8MYP8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODF3BA8MYP8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF3BA8MYP8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF3BA8MYP8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF3BA8MYP8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF3BA8MYP8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF3BA8MYP8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF3BA8MYP8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF3BA8MYP8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF3BA8MYP8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODF3BA8MYP8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODF3BA8MYP8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ODF3BA8MYP8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODF3BA8MYP8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODF3BA8MYP8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODF3BA8MYP8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODF3BA8MYP8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODF3BA8MYP8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODF3BA8MYP8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF3BA8MYP8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF3BA8MYP8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF3BA8MYP8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF3BA8MYP8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF3BA8MYP8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF3BA8MYP8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF3BA8MYP8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF3BA8MYP8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF3BA8MYP8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF3BA8MYP8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF3BA8MYP8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF3BA8MYP8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF3BA8MYP8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF3BA8MYP8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF3BA8MYP8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF3BA8MYP8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ODF3BA8MYP8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF3BA8MYP8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF3BA8MYP8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF3BA8MYP8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF3BA8MYP8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF3BA8MYP8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF3BA8MYP8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF3BA8MYP8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF3BA8MYP8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF3BA8MYP8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF3BA8MYP8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF3BA8MYP8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ODF3BA8MYP8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF3BA8MYP8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF3BA8MYP8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF3BA8MYP8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF3BA8MYP8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF3BA8MYP8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF3BA8MYP8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF3BA8MYP8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF3BA8MYP8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF3BA8MYP8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ODF3BA8MYP8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ODF3BA8MYP8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ODF3BA8MYP8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ODF3BA8MYP8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ODF3BA8MYP8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ODF3BA8MYP8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms